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ONNX(Open Neural Network Exchange) 是一种针对机器学习所设计的开放式的文件格式,经常作为不同框架模型转化的中间文件。有时我们拿到ONNX文件,想将它进行一些修改,比如:

  • 删除部分节点。 比如,ONNX文件中一些前后处理的算子节点,以方便后续部署。
  • 修改节点输入输出名。 比如修改某一节点的输入输出名称,更改模型拓扑结构。
  • 修改节点属性值
  • 增加新节点

目前常用的方法是,先可视化模型图结构,然后基于ONNX的Python API编写脚本,对模型图结构进行编辑。但这可能需要我们在可视化-脚本-可视化-...之间反复横跳。而且在一张庞大的图上搜集想要修改的节点,也比较繁琐耗时。👋

能不能有一个工具,可以实时预览编辑后的可视化效果,从而更方便,快捷,直观地实现ONNX模型的编辑呢?:rocket: 这便是onnx-modifier (github)开发的动机。所有的编辑信息将最终汇总,统一送由ONNX Python API处理,得到编辑后的ONNX模型文件。

目前已支持下列操作:

删除/恢复节点
增加新节点
修改节点输入输出名
修改模型输入输出名
增加模型输出节点
增加模型输入节点
修改节点属性值
修改模型batch size
修改模型initializers

onnx-modifier基于流行的模型可视化工具 Netron 和轻量级Web应用框架 Flask 开发。希望它能给社区带来一些贡献~

安装与运行

目前支持两种方法运行onnx-modifier

源码+命令行启动

  • 拉取onnx-modifier,安装所需要的Python库

    git clone https://github.com/ZhangGe6/onnx-modifier.git
    cd onnx-modifier
    
    pip install -r requirements.txt
  • 运行

    python app.py

从可执行文件启动

  • Windows: 下载可执行文件onnx-modifier.exe (28.3MB) Google Drive / Baidu NetDisk,双击即可启动。
    • 默认使用Edge浏览器作为运行环境。

生成可执行文件的步骤记录在app_desktop.py文件中。未来会为其他平台生成可执行文件。

点击输出中的url(默认为http://127.0.0.1:5000/),即可在浏览器中进入onnx-modifier界面。点击Open Model...,上传所需要编辑的模型文件,上传完毕后,网络可视化结构会自动显示。

用法

图结构层级的操作按钮放置在可视化页面的左上角,目前有三个:ResetDownloadAdd node. 它们的功能分别为:

  • Reset:重置模型图结构为导入时的初始状态;

  • Download:保存编辑后的模型文件到本地。按钮右边的两个复选框(对应功能可能还不够鲁棒

    • 如果选中shape inferece,则会在保存模型时自动做形状推导

      当前形状推导功能基于onnx-tool实现。

    • 如果选中clean up,则会在保存时自动删掉无用节点 (类似ONNX GraphSurgeon)。

  • Add node:向当前模型中,添加新节点。

节点层级的操作都在节点侧边栏里,点击某一节点后即可弹出。

一起来详细康康。

删除/恢复节点

删除节点有两种模式:Delete With ChildrenDelete Single Node. 后者只删除当前单个节点;而前者还会自动删除以这个节点为根节点的所有子节点,当我们需要删除一长串节点时,这个功能会比较有用。

Delete With Children基于回溯算法实现。

执行删除操作后,被删除的节点首先会变灰显示,以供预览。如果某一个节点被误删了,在该节点的侧边栏点击Recover Node即可以将其恢复到图中。预览确认删除操作无误后,点击Enter,图结构会刷新,显示节点删除后的状态。

一个典型的删除操作如下图所示:

增加新节点

有时候我们希望向模型中添加新节点。onnx-modifier已开始支持该功能。

在主页面的左上方,有一个Add node按钮和一个selector选择器,我们可以通过这二者的配合,完成节点的添加,只需3步:

  1. 在selector中选择要添加的节点类型,在点击Add node按钮后,一个对应类型的新节点将自动出现在图上。

    selector中包含来自ai.onnx(171), ai.onnx.preview.training(4), ai.onnx.ml(18) 和 com.microsoft(1)的所有节点类型。

  2. 点击这个新节点,在弹出的侧边栏中进行节点的编辑:

    • 节点属性:初始化为null (显示为undefined)。同上节,在对应的属性框中输入新值即可。
    • 修改节点输入输出名。输入输出名决定了节点将插入在图结构中的位置。
  3. 完工(点击Download即可获得编辑后的ONNX模型)。

以下是该功能的一些提醒和小tip:

  1. 点击节点侧边栏的NODE PROPERTIEStype框右侧的?,和节点属性框右侧的+,可以显示关于当前节点类型/属性值的参考信息。
  2. 为确保正确性,节点的各属性值建议全部填写(而不是留着undefined)。默认值在当前版本可能支持得还不够好。
  3. 如果一个属性值是列表类型,则各元素之间使用‘,’分隔,无需'[]'。
  4. 在当前版本中,如果一个节点的输入/输出是一个列表类型(如Concat),限制最多显示8个。如果一个节点实际输入/输出小于8个,则填写对应数目的输入输出即可,多出来的应以list_custom开头,它们会在后续处理中自动被忽略。

修改节点输入输出名

通过修改节点的输出输出名,我们可以对模型拓扑结构进行修改(如删除一些预处理/后处理节点)。该功能同样可以用在更改模型的输出的名称(即修改模型叶子节点的输出名)。

那在onnx-modifer中要怎么做呢?很简单,找到节点侧边栏的输入输出对应的输入框,键入新的名称就可以啦。图结构会根据键入的名称即时自动刷新。

举个栗子,在下图所示的模型中,我们想要删除预处理对应的节点(Sub->Mul->Sub->Transpose),可以这样做:

  1. 点击第一个Conv节点,在弹出的属性栏中,将输入名称改为serving_default_input:0 (data_0节点的输出名);
  2. 图结构自动刷新,可以发现,输入节点已经和第一个Conv节点直接相连,几个预处理节点也已经从前向图中分离出来,将它们删除;
  3. 完工(点击Download就可以获得编辑后的ONNX模型啦)。

如果我们希望通过修改,让节点$A$(比如上例中的data_0节点)连向节点$B$(比如上例中的第一个Conv节点),建议的方式是:将节点$B$的输入名称修改为节点$A$的输出名称,而不是把$A$的输出名称修改为节点$B$的输入名称。 因为节点$B$的输入名称可能同时为其他节点(比如上例中的Transpose节点)的输出名称,会导致一些预料外的结果。

上例的修改过程如下图所示:

修改模型输入输出名称

点击模型输入或输出节点,在弹出的侧边栏中,为模型输入输出键入新的名称即可。

rename_model_io

增加模型输出节点

有时候我们需要增加/抽取某个特定节点的输出作为整个模型的输出。比如之前的模型输出节点在编辑过程中被删除了,需要增加新的,或者有时候我们需要抽取一些中间层特征输出做更细致的分析。

通过onnx-modifier,我们只需要在对应节点的侧边栏中,点击Add Output按钮即可在该节点后部增加一个模型输出节点,其名称与原节点的输出名相同。

如下图,我们增加了两个模型输出节点,分别为第一个卷积层的输出和第二个卷积层的输出。

add_new_outputs

增加模型输入节点

有时我们需要给模型增加输入。典型的场景是从一个模型中抽取出一个子模型后,这个子模型缺少输入节点。基于onnx-modifier,我们可以通过以下步骤实现:

  1. 点击要增加输入的节点,在弹出的侧边栏中,点击“Add Input”按钮;
  2. 此时会弹出对话框。从其中的下拉选择框中选择要增加的输入名称,在下面的输入框中填入shape信息。然后点击confirm按钮即可。

add_new_inputs

注:输入的shape信息格式应为"dtype[dim0, dim1, ...]",比如"float32[1,3, 224,224]". 如果输入不符合这种格式,则会在下方显示红色警告信息,同时"confirm"按钮也会失效。有时候,shape信息已经被预先填好了,对应的信息是从模型分析得到的(一般是可以直接使用的)。如果没有被预先填充,则需要我们手工填入。

修改节点属性值

在节点侧边栏对应的属性值输入框中,键入新的属性值即可。

点击属性值输入框右侧的+,可显示该属性的参考信息。

修改模型batch size

动态batch size和固定batch size均已支持。

  • 动态batch size:点击Dynamic batch size即可;
  • 动态bacth size:在Fixed batch size后方输入框内填入预期的batch size值;

修改模型initializers

有时候我们要修改一些保存在模型initializer中的数值,比如卷积层的权重/偏置参数,Reshape节点的shape参数等。使用onnx-modifier,这一操作将非常简单:在对应节点侧边栏的initializer中键入新的数值,点击Download即可。

如果要修改我们新增加的节点的initializer,除了键入其数值之外,还要键入其数据类型。(如果我们不确定数据类型,可以点击NODE PROPERTIES->type->?,在弹出的节点的详细介绍界面中,可能会找到线索。)

当前版本已支持从numpy文件中读取initializer数据。点击“Open *.npy”按钮,在弹出的对话框中选择numpy文件,数据便会自动解析并呈现在上方的输入框中,也支持在读取的数据基础上进一步编辑。

onnx-modifer正在活跃地更新中:hammer_and_wrench:。 欢迎使用,提issue,如果有帮助的话,感谢给个:star:~

示例模型文件

为方便测试,以下提供一些典型的样例模型文件,主要来自于onnx model zoo

参考资料