code et informations

Data :

https://www.rmsb.u-bordeaux.fr/nextcloud/index.php/s/6oMjTeDtmREpMgC

Logiciel de segmentation :

• ITK-snap : http://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php
• Slicer : https://www.slicer.org/
• FIJI : https://fiji.sc/

Pre/post-processing :

• Slicer : https://www.slicer.org/
• FSL : https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/
• ANTS : http://stnava.github.io/ANTs/
• Python :
  • NIPY: https://nipy.org/
  • N4BiasField https://github.com/bigbigbean/N4BiasFieldCorrection

Visualisation :

• Mango : http://ric.uthscsa.edu/mango/
• FSLEYES : https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FSLeyes#Install_standalone_build_.28recommended.29

python module

• NIPY
• nilearn