diff --git a/docs/404.html b/docs/404.html
index 086a5c9e..5f813f61 100644
--- a/docs/404.html
+++ b/docs/404.html
@@ -18,8 +18,9 @@
-
404
+
ERREUR 404
+
Cette page n'existe pas ou n'existe plus
+
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Page not found :(
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The requested page could not be found.
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-* [JAVA](https://github.com/ansforge/annuaire-sante-fhir-documentation/tree/feature/documentation-jekyll/samples/asaf-openfhir-java/modules/api-usage-tests/src/test/java/fr/ans/asaf/demo){:target="_blank"}
-* [PHP](https://github.com/ansforge/annuaire-sante-fhir-documentation/tree/feature/documentation-jekyll/samples/afas-openfhir-php/samples){:target="_blank"}
-* [C#](https://github.com/ansforge/annuaire-sante-fhir-documentation/tree/feature/documentation-jekyll/samples/afas-openfhir-dotnet/){:target="_blank"}
+* [JAVA](https://github.com/ansforge/annuaire-sante-fhir-documentation/tree/9cbfea28350878da45a2e01bdc8daf661ecb7202/samples/asaf-openfhir-java){:target="_blank"}
+* [PHP](https://github.com/ansforge/annuaire-sante-fhir-documentation/tree/9cbfea28350878da45a2e01bdc8daf661ecb7202/samples/afas-openfhir-php){:target="_blank"}
+* [C#](https://github.com/ansforge/annuaire-sante-fhir-documentation/tree/9cbfea28350878da45a2e01bdc8daf661ecb7202/samples/afas-openfhir-dotnet){:target="_blank"}
diff --git a/docs/pages/documentation/starters/postman-starter.md b/docs/pages/documentation/starters/postman-starter.md
index 721000bd..05a6a0ac 100644
--- a/docs/pages/documentation/starters/postman-starter.md
+++ b/docs/pages/documentation/starters/postman-starter.md
@@ -20,5 +20,5 @@ Voici les variables utilisées dans le projet Postman:
| Variable | Description | Valeur |
|----------|--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------|---------------------------------------|
-| api_key | Clé d'API (Si vous n'avez pas de clé, veuillez suivre la procédure décrite [ici](/annuaire-sante-fhir-documentation/pages/quick-start/readme)) | Saisissez votre clé |
+| api_key | Clé d'API (Si vous n'avez pas de clé, veuillez suivre la procédure décrite [ici](/annuaire-sante-fhir-documentation/pages/quick-start/quick-start.html)) | Saisissez votre clé |
| api_url | L'url d'accès à l'API | https://gateway.api.esante.gouv.fr/fhir |
diff --git a/docs/pages/use-cases/segur/uc-segur-draft.md b/docs/pages/use-cases/segur/uc-segur-draft.md
deleted file mode 100644
index 3526e526..00000000
--- a/docs/pages/use-cases/segur/uc-segur-draft.md
+++ /dev/null
@@ -1,1017 +0,0 @@
----
-layout: default
-title: "Extraction des acteurs du Ségur du Numérique en Santé"
-subTitle: Cas d'utilisation
----
-
- #### Dans cette page
-
-- [1) LE SEGUR](#se-header)
-- [2) LES COULOIRS](#co-header)
- - [2.1) Le couloir ESMS](#es-header)
- - [2.1.1) Définition](#es-header-1)
- - [2.1.2) Requêtes](#es-header-2)
- - [2.1.2.1) MS1](#es-header-21)
- - [2.1.2.2) MS2](#es-header-22)
- - [2.1.2.3) MS3](#es-header-23)
- - [2.2) Le couloir Hôpital](#ho-header)
- - [2.1.1) Définition](#ho-header-1)
- - [2.1.2) Requêtes](#ho-header-2)
- - [2.3) Le couloir biologie médicale](#bi-header)
- - [2.1.1) Définition](#bi-header-1)
- - [2.1.2) Requêtes](#bi-header-2)
- - [2.4) Le couloir Radiologie](#ra-header)
- - [2.1.1) Définition](#ra-header-1)
- - [2.1.2) Requêtes](#ra-header-2)
- - [2.4) Le couloir Médecine de Ville](#me-header)
- - [2.1.1) Définition](#me-header-1)
- - [2.1.2) Requêtes](#me-header-2)
- - [2.6) Le couloir Officine](#of-header)
- - [2.1.1) Définition](#of-header-1)
- - [2.1.2) Requêtes](#of-header-2)
-
-
-
-## 1) LE SEGUR
-Le Ségur du numérique vise à développer le partage des données de santé entre les différents acteurs de la prise en charge et les patients, par le financement d’une mise à jour logicielle prise en charge par l’Etat pour favoriser l’augmentation des usages numériques dans les établissements.
-
-Les établissements de santé peuvent être accompagnés par les acteurs régionaux (ARS, GRADeS) dans leur déploiement, le pilotage de services socles nationaux et leur mise en conformité réglementaire.
-
-Le Ségur du Numérique en Santé s’articule autour de 6 types de d'acteurs appelés couloirs.
-Nous allons vous détailler ci-dessous comment interroger l'API pour identifier les acteurs présents dans chaque couloir : [segurnumerique.sante-idf.fr](https://segurnumerique.sante-idf.fr/segur-et-services-socles/les-couloirs/).
-
-
-## 2) LES COULOIRS
-
-### 2.1) Le couloir ESMS
-
-#### 2.1.1) Définition
-
-Ce Couloir est défini par des types d’activité regroupés en sous-domaines et est en fonction de catégories d’établissement FINESS [CEF] :
-
- * Liste sous-domaines > Types d’activités :
- * MS1 > PA / PH / DOM : Personnes Agées / Personnes en situation de Handicap / DOMicile
- * MS2 > PDE / PDS : Protection De l'Enfance / Personnes concernées par des Difficultés Spécifiques
- * MS3 > AHI : Accueil l’Hébergement et l’Insertion
- * Liste sous-domaines > Types d’activité > codes de catégorie d’établissement :
- * MS1 :
- * PA : 202 ; 207 ; 381 ; 500 ; 501 ; 502
- * PH : 182 ; 183 ; 186 ; 188 ; 189 ; 190 ; 192 ; 194 ; 195 ; 196 ; 198 ; 221 ; 238 ; 246 ; 247 ; 249 ; 252 ; 253 ; 255 ; 370 ; 377 ; 379 ; 382 ; 390 ; 395 ; 396 ; 402 ; 437 ; 445 ; 446 ; 448 ; 449
- * DOM : 209 ; 354 ; 460 ; 462
- * MS2 :
- * PDS : 165 ; 178 ; 180 ; 197 ; 213 ; 608
- * PDE : 159 ; 166 ; 172 ; 175 ; 176 ; 177 ; 236 ; 241 ; 286 ; 295 ; 344 ; 378 ; 411 ; 418 ; 427 ; 440 ; 441 ; 453
- * MS3 :
- * AHI : 214 ; 216 ; 219 ; 258 ; 259 ; 442
-
-
-
-#### 2.1.2) Requêtes :
-
-Afin de récupérer les ESMS, il faut interroger l'endpoint Organization.
-
-Nous appliquerons deux filtres aux requêtes afin d'obtenir le résultats attendus :
-
-
- * la catégorie d'Organization parmi la liste ci-dessous (point 2 sur l'image ci-dessous)
- * l'Identifier : [finess.sante.gouv.fr](http://finess.sante.gouv.fr) (point 1 sur l'image ci-dessous)
-
-
-
-#### 2.1.2.1 ) MS1
-
-Liste des codes catégorie MS1 :
-* [PA] : 202 ; 207 ; 381 ; 500 ; 501 ; 502
-* [PH] : 182 ; 183 ; 186 ; 188 ; 189 ; 190 ; 192 ; 194 ; 195 ; 196 ; 198 ; 221 ; 238 ; 246 ; 247 ; 249 ; 252 ; 253 ; 255 ; 370 ; 377 ; 379 ; 382 ; 390 ; 395 ; 396 ; 402 ; 437 ; 445 ; 446 ; 448 ; 449
-* [DOM] : 209 ; 354 ; 460 ; 462
-
-{:style="max-width:670px"}
-
-Pour information, ces codes font partie de la [TRE-R66-CategorieEtablissement](https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R66-CategorieEtablissement/FHIR/TRE-R66-CategorieEtablissement).
-
-
-
-
-{% highlight bash %}
-1) Faire un appel sur le endpoint Organization en filtrant sur les Organization qui ont :
-- un identifier Finess (identifier=http%3A%2F%2Ffiness.sante.gouv.fr%7C)
-- et qui ont un "type" parmi la liste ci-dessus
-(&type=https%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C202...)
-2) Répeter l'opération sur toutes les pages (1)
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight bash %}
-curl \
- -H "ESANTE-API-KEY: {{site.ans.demo_key }}" \
- -X POST "{{site.ans.api_url}}/fhir/Organization/_search?type=https%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C202%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C207%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C381%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C463%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C500%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C501%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C502%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C182%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C183%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C186%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C188%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C189%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C190%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C192%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C194%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C195%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C196%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C198%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C221%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C238%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C246%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C247%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C249%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C252%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C253%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C255%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C370%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C377%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C379%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C382%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C390%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C395%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C396%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C402%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C437%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C445%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C446%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C448%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C449%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C209%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C354%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C460%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C462"
-
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight java %}
-var client = createClient();
-
-// construct category search clause
-var codes = Arrays.asList("202","207","381","463","500","501","502","182","183","186","188","189","190","192","194","195","196","198","221","238","246","247","249","252","253","255","370","377","379","382","390","395","396","402","437","445","446","448","449","209","354","460","462");
-var activityClause = Organization.TYPE.exactly()
- .systemAndValues("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R66-CategorieEtablissement/FHIR/TRE-R66-CategorieEtablissement", codes);
-
-// construct identifier search clause
-var identifierClause = Organization.IDENTIFIER.hasSystemWithAnyCode("http://finess.sante.gouv.fr");
-
-// create and execute request
-var bundle = client
- .search()
- .forResource(Organization.class)
- .where(activityClause)
- .and(identifierClause)
- .returnBundle(Bundle.class)
- .execute();
-
-var hasNext = true;
-var finessOrganizations = new LinkedList<>();
-
-// for each page
-do {
- logger.info("Total result {}", bundle.getTotal());
-
- // extract data from bundle
- finessOrganizations.add(bundle.getEntry());
-
- if (bundle.getLink("next") != null) {
- // get the next page
- bundle = client
- .loadPage()
- .byUrl(bundle.getLink("next").getUrl())
- .andReturnBundle(Bundle.class)
- .execute();
- } else {
- hasNext = false;
- }
-} while(hasNext);
-{% endhighlight %}
-
-
-
-
-{% highlight bash %}
-1) Faire un appel sur le endpoint Organization en filtrant sur les Organization qui ont :
-- un identifier Finess (identifier=http%3A%2F%2Ffiness.sante.gouv.fr%7C)
-- et qui ont un "type" parmi la liste ci-dessus
-(&type=https%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C165...)
-2) Répeter l'opération sur toutes les pages (1)
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight bash %}
-curl \
- -H "ESANTE-API-KEY: {{site.ans.demo_key }}" \
- -X POST "{{site.ans.api_url}}/fhir/Organization/_search?type=https%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C165%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C178%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C180%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C197%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C213%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C159%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C166%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C172%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C175%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C176%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C177%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C236%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C241%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C286%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C295%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C344%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C378%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C411%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C418%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C427%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C440%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C441%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C453%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C608"
-
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight java %}
-var client = createClient();
-
-// construct category search clause
-var codes = Arrays.asList("165","178","180","197","213","159","166","172","175","176","177","236","241","286","295","344","378","411", "418","427","440","441","453","608");
-var activityClause = Organization.TYPE.exactly()
- .systemAndValues("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R66-CategorieEtablissement/FHIR/TRE-R66-CategorieEtablissement", codes);
-
-// construct identifier search clause
-var identifierClause = Organization.IDENTIFIER.hasSystemWithAnyCode("http://finess.sante.gouv.fr");
-
-// create and execute request
-var bundle = client
- .search()
- .forResource(Organization.class)
- .where(activityClause)
- .and(identifierClause)
- .returnBundle(Bundle.class)
- .execute();
-
-var hasNext = true;
-var finessOrganizations = new LinkedList<>();
-
-// for each page
-do {
- logger.info("Total result {}", bundle.getTotal());
-
- // extract data from bundle
- finessOrganizations.add(bundle.getEntry());
-
- if (bundle.getLink("next") != null) {
- // get the next page
- bundle = client
- .loadPage()
- .byUrl(bundle.getLink("next").getUrl())
- .andReturnBundle(Bundle.class)
- .execute();
- } else {
- hasNext = false;
- }
-} while(hasNext);
-{% endhighlight %}
-
-
-
-
-{% highlight bash %}
-1) Faire un appel sur le endpoint Organization en filtrant sur les Organization qui ont :
-- un identifier Finess (identifier=http%3A%2F%2Ffiness.sante.gouv.fr%7C)
-- et qui ont un "type" parmi la liste ci-dessus
-(&type=https%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C214...)
-2) Répeter l'opération sur toutes les pages (1)
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight bash %}
-curl \
- -H "ESANTE-API-KEY: {{site.ans.demo_key }}" \
- -X POST "{{site.ans.api_url}}/fhir/Organization/_search?type=https%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C214%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C216%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C219%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C258%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C259%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R66-CategorieEtablissement%2FFHIR%2FTRE-R66-CategorieEtablissement%7C442"
-
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight java %}
-var client = createClient();
-
-// construct category search clause
-var codes = Arrays.asList("214","216","219","258","259","442");
-var activityClause = Organization.TYPE.exactly()
- .systemAndValues("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R66-CategorieEtablissement/FHIR/TRE-R66-CategorieEtablissement", codes);
-
-// construct identifier search clause
-var identifierClause = Organization.IDENTIFIER.hasSystemWithAnyCode("http://finess.sante.gouv.fr");
-
-// create and execute request
-var bundle = client
- .search()
- .forResource(Organization.class)
- .where(activityClause)
- .and(identifierClause)
- .returnBundle(Bundle.class)
- .execute();
-
-var hasNext = true;
-var finessOrganizations = new LinkedList<>();
-
-// for each page
-do {
- logger.info("Total result {}", bundle.getTotal());
-
- // extract data from bundle
- finessOrganizations.add(bundle.getEntry());
-
- if (bundle.getLink("next") != null) {
- // get the next page
- bundle = client
- .loadPage()
- .byUrl(bundle.getLink("next").getUrl())
- .andReturnBundle(Bundle.class)
- .execute();
- } else {
- hasNext = false;
- }
-} while(hasNext);
-{% endhighlight %}
-
-
-
- * SA01 ; SA02 ; SA03 ; SA04 ; SA30 ; SA34 ; SA36
- * Dans le cas d’une EG, sont exclues les catégories d’établissements FINESS du secteur médico-social (voir ci-dessus)
-
-
-
-
-#### 2.2.2) Requête
-
-Afin de récupérer les établissements sanitaires, nous devons interroger l'endpoint de recherche transactionnel en deux étapes :
-
- * Récupérer les établissements sanitaires (champs 1 dans l'image ci-dessous)
- * Vérifier que le type de l'établissement ne correspond pas à un établissement médico-social (champs 2 dans l'image ci-dessous)
-
-
-
-
-
-Liste des secteurs d'activité: SA01;SA02;SA03;SA04;SA30;SA34;SA36
-
-
-{:style="max-width:670px"}
-
-
-Note : La liste des codes des établissements sanitaires (ex: SA01, SA02, etc...) se trouve dans le référentiel : [TRE-R02-SecteurActivite](https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R02-SecteurActivite/FHIR/TRE-R02-SecteurActivite/)
-
-
-
-
-{% highlight bash %}
-1) Faire un appel sur le endpoint Organization en filtrant sur les Organization qui ont un secteur d'activité parmi la liste ci-dessus
-(&type=https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R02-SecteurActivite/FHIR/TRE-R02-SecteurActivite/%7CSA01&type=https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R02-SecteurActivite/FHIR/TRE-R02-SecteurActivite/%7CSA02 ...).
-2) Vérifier que pour chaque établissement, son type n'est pas présent dans la liste des catégories "médico-sociaux"
-(voir la liste dans le use case précédent).
-3) Répeter l'opération sur toutes les pages (1)
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight bash %}
-curl \
- -H "ESANTE-API-KEY: {{site.ans.demo_key }}" \
- "{{site.ans.api_url}}/fhir/v1?_getpages=b109ca26-32eb-416f-8c8a-fee6c6597bb9&_pageId=lZg9MO8QrAVQZoT5uxjWir7vNAEr7AGfqD_nysfrz5wl53MhYmudRGTxjJfwUVMYuYOdvQq4OASgzZbCGJjhb7EH19BN-GH2uG5r5q9ZT680D729MuB8AQowHOP0m-nlaq5JQ3eWKdOAc4z6ZlPQSKRIa2LDXto2BFdF4cEs2TVtK1uJsLVSBVq6JJElmJv5vrd0wkQaaf9H5HNBJG_W1g4gIxbflOSdm8MMyIAvA_Jm6tKvrcC9kFA5Rqn0_FawrKQJbmA2hi0ZbTJaZmaNHJSRA05shFi4vQMBSL0jqs1vo3bZCgFquO5qHyghvwrqmanzRhMjWzSGwanYS4jdpuScMd-btLsRIobeF9bNhGS3bcAVcS3a6SuUkya1H-nfd5XP957ZzPFP-hPsjHuSk4oXbbxYirHZFaKHMrdM3dmXbOdHzPsbgxA9-6RhJgwtlXzOuBToLIQ9VPQrL5F1Z0VeDkpHN50pG445m9Y6zL-YmKruLhsEvfnW0f3PgDKnIUZsFQNMmTetD7vRMlfxiPBws5J7d0HJB1WFG-Qk0n6q6hW4PStx9lsvmSS5Ggkg5At7ko005tiVj50SjbvTz9Bgj-4MfVHpmzY5og8avqHwci6Vo4iE57W4QaGuEQFKkFp2aDF6kBpY8SmKAbYGS08NjjiXqHSpsaj0PxGaS5NMX0vf69eQSd1X8HVQtFlbZubcKQs-F3wrZwp4J9a_Tfhd913wZB5wDHA1C226GfnhFQ5jx2BilMUjw-sVDb-_RmWsDYPG&_bundletype=searchset"
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight java %}
-var client = createClient();
-
-// hospital:
-var bHospital = client.search().forResource(Organization.class)
- .where(Organization.TYPE.exactly().codes("SA01","SA02","SA03","SA04","SA30","SA34","SA36"))
- .returnBundle(Bundle.class).execute();
-var totalHospital = bHospital.getTotal();
-var typesAsStringList = Arrays.asList("159","165","166","172","175","176","177", "178","180","182","183","186","188","189","190","192","194","195","196","197","198","202","207","209","213","221","236","238","241","246","247","249","252","253","255","286","295","344","354","370","377","378","379","381","382","390","395","396","402","411","418","427","437","440","441","445","446","448","449","453","460","462","500","501","502");
-var goodElements = new ArrayList<>();
-var hasNext = true;
-var treated = 0;
-
-logger.info("Total results - {}", bHospital.getTotal());
-
-do {
- var bundleContent = bHospital.getEntry();
- logger.info("Treat {} entry(ies)", bundleContent.size());
-
- for (var e : bundleContent) {
- var org = (Organization) e.getResource();
- var isHospital = true;
-
- // check hospital system & code
- for (var type : org.getType()) {
- for (var coding : type.getCoding()) {
- if ("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R66-CategorieEtablissement/FHIR/TRE-R66-CategorieEtablissement".equals(coding.getSystem()) &&
- typesAsStringList.contains(coding.getCode())) {
- isHospital = false;
- break;
- }
- }
- }
-
- // filter good elements
- if(isHospital) {
- goodElements.add(org);
- }
- }
-
- // check if result has a next page
- if (bHospital.getLink("next")!=null) {
- bHospital = client.loadPage().byUrl(bHospital.getLink("next").getUrl()).andReturnBundle(Bundle.class).execute();
- } else {
- hasNext = false;
- }
-
- treated += bundleContent.size();
- logger.info("Progress treated - {} / {}", treated, bHospital.getTotal());
-} while (hasNext);
-
-logger.info("Total global - {}", totalHospital);
-logger.info("Total Hospital - {}", goodElements.size());
-{% endhighlight %}
-
-
-
-
-### 2.3) Le couloir Biologie Médicale
-
-#### 2.3.1) Définition
-
-Ce Couloir est défini par les secteurs d’activité suivants :
-
- * SA25 ; SA29
-
-
-
-**NOS :**
-
- * Secteurs d’activité : [TRE-R02-SecteurActivite](https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R02-SecteurActivite/FHIR/TRE-R02-SecteurActivite/).
-
-
-
-#### 2.3.2) Requête
-
-Afin de récupérer les laboratoires de biologie médicale de ville et en établissements de santé, nous devons interroger l'endpoint Organization :
-
- * En filtrant sur le type = SA25, SA29
-
-
-
-
-{:style="max-width:670px"}
-
-
-
-{% highlight bash %}
-1) Faire un appel sur le endpoint Organization en filtrant sur les Organization qui ont un type SA25 ou SA29 (&type=SA25,SA29).
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight bash %}
-curl \
- -H "ESANTE-API-KEY: {{site.ans.demo_key }}" \
- "{{site.ans.api_url}}/fhir/Organization?type=https%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R02-SecteurActivite%2FFHIR%2FTRE-R02-SecteurActivite%7CSA25%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R02-SecteurActivite%2FFHIR%2FTRE-R02-SecteurActivite%7CSA29"
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight java %}
-var client = createClient();
-
-// construct type search clause
-var codes = Arrays.asList("SA25","SA29");
-var activityClause = Organization.TYPE.exactly()
- .systemAndValues("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R02-SecteurActivite/FHIR/TRE-R02-SecteurActivite", codes);
-
-// construct identifier search clause
-var identifierClause = Organization.IDENTIFIER.hasSystemWithAnyCode("http://finess.sante.gouv.fr");
-
-// create and execute request
-var bundle = client
- .search()
- .forResource(Organization.class)
- .where(activityClause)
- .and(identifierClause)
- .returnBundle(Bundle.class)
- .execute();
-
-var hasNext = true;
-var finessOrganizations = new LinkedList<>();
-
-// for each page
-do {
- logger.info("Total result {}", bundle.getTotal());
-
- // extract data from bundle
- finessOrganizations.add(bundle.getEntry());
-
- if (bundle.getLink("next") != null) {
- // get the next page
- bundle = client
- .loadPage()
- .byUrl(bundle.getLink("next").getUrl())
- .andReturnBundle(Bundle.class)
- .execute();
- } else {
- hasNext = false;
- }
-} while(hasNext);
-{% endhighlight %}
-
-
-
-
-
-### 2.4) Le couloir Radiologie
-
-#### 2.4.1) Définition
-
-Ce Couloir est défini par les secteurs d’activité suivants :
-
- * SA07 ; SA08 ; SA09
- * Avec au moins un PS
- * dont le code profession = 10
- * qui possède un savoir-faire parmi : SM28 ; SM44 ; SM45 ; SM55
-
-
-
-#### 2.4.2) Requête
-
-Afin de récupérer les cabinets de médecins radiologues libéraux et les plateaux d’imagerie des établissements de santé., nous devons interroger l'endpoint Organization :
-
- * En filtrant sur le paramètre de recherche type = SA07, SA08, SA09
- * En incluant les PractitionerRole liés aux Organizations afin de pouvoir filtrer ensuite sur le paramètre de recherche speciality = SM28,SM44,SM45,SM55
-
-
-
-
-
-Une fois l’ensemble des données récupéré, procédez aux filtres suivant :
-
-Les PractitionerRoles doivent correspondre à la profession de santé "Médecin" (10) (champs code du PractitionerRole comme le montre le point 3 sur l'image ci-dessous).
-
-Ensuite les PractitionerRoles souhaités doivent correspondre aux spécialités : SM28, SM44, SM45, SM55 (champs specialty du PractitionerRole comme le montre le point 2 sur l'image ci-dessous).
-
-Enfin, faut regrouper les PractitionerRoles pour les lier aux bonnes Organizations (champ organization du PractitionerRole comme le montre le point 1 sur l’image ci-dessous)
-
-
-Nous pouvons finalement ne récupérer que les Organizations contenant des PractitionerRoleRoles selon les filtres que nous avons appliqués.
-
-
-
-{:style="max-width:670px"}
-
-
-
-Note: la liste des codes des établissements sanitaires (ex: SA07, etc...) se trouve dans le référentiel : [TRE-R02-SecteurActivite](https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R02-SecteurActivite/FHIR/TRE-R02-SecteurActivite/).
-La liste des profession est disponible dans le référentiel [TRE-G15-ProfessionSante](https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_G15-ProfessionSante/FHIR/TRE-G15-ProfessionSante).
-La liste des code spécialités est disponibles dans le référentiel [TRE_R38-SpecialiteOrdinale](https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R38-SpecialiteOrdinale/FHIR/TRE-R38-SpecialiteOrdinale)
-
-
-
-
-{% highlight bash %}
-1) Faire un appel sur l'endpoint Organization en filtrant sur les Organization ayant un type = SA07, SA08 ou SA09.
-Cet appel devra inclure les PractitionerRoles attachés (&_revinclude=PractitionerRole:organization)
-2) Pour chacun des PractitionerRole retournés, vérifier qu'il y a au moins 1 Role (champs role) avec pour :
-- system = "https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_G15-ProfessionSante/FHIR/TRE-G15-ProfessionSante"
-- et un code = 10 (médecin)
-3) Pour chacun des PractitionerRole filtrés, vérifier qu'il y a au moins 1 Spécialité (champs speciality) avec pour :
-- system = "https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R38-SpecialiteOrdinale/FHIR/TRE-R38-SpecialiteOrdinale"
-- et un code = SM28, SM44, SM45 ou SM55
-4) Pour chacun des PractitionerRole trouvés et filtrés, récupérer les Organization qui ont le même id que le champs organization du PractitionerRole
-5) Répeter l'opération sur toutes les pages (1)
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight bash %}
-curl \
- -H "ESANTE-API-KEY: {{site.ans.demo_key }}" \
- "{{site.ans.api_url}}/fhir/Organization?type=SA07%2CSA08%2CSA09&_revinclude=PractitionerRole%3Aorganization"
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight java %}
-var client = createClient();
-var hasNext = true;
-Bundle orgBundle = null;
-var totalElements = 0;
-var goodElements = new ArrayList<>();
-var treated = 0;
-var nbRoles = 0;
-
-// construct radiology facility request
-try {
-orgBundle = client.search().forResource(Organization.class)
-.where(Organization.TYPE.exactly().codes("SA07", "SA08", "SA09"))
-.revInclude(PractitionerRole.INCLUDE_ORGANIZATION)
-.returnBundle(Bundle.class).execute();
-
- totalElements = orgBundle.getTotal();
-} catch (Exception e) {
-e.printStackTrace();
-hasNext = false;
-}
-
-logger.info("Total results - {}", orgBundle.getTotal());
-
-do {
-var bundleContent = orgBundle.getEntry();
-var organizationMap = new LinkedHashMap();
-
- for (var e : bundleContent) {
- // store the organization inside a map
- if(e.getResource() instanceof Organization) {
- var org = (Organization) e.getResource();
- organizationMap.put(org.getId(), org);
- treated++;
- }
-
- if(e.getResource() instanceof PractitionerRole) {
- var role = (PractitionerRole) e.getResource();
- var medic = false;
- var radiologist = false;
-
- nbRoles++;
-
- // check if the Role contains a medic
- for(var code : role.getCode()) {
- for(var coding : code.getCoding()) {
- if (coding.getSystem().equals("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_G15-ProfessionSante/FHIR/TRE-G15-ProfessionSante") &&
- coding.getCode().equals("10")) {
- medic = true;
- break;
- }
- }
- }
-
- if(medic) {
- var specialtyStringList = Arrays.asList("SM28", "SM44", "SM45", "SM55");
-
- // if a medic was found, check its specialties to filter only radiologist
- for (var code : role.getSpecialty()) {
- for (var coding : code.getCoding()) {
- logger.info("Specialty Coding {} - {}", coding.getSystem(), coding.getCode());
- if (coding.getSystem().equals("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R38-SpecialiteOrdinale/FHIR/TRE-R38-SpecialiteOrdinale") &&
- specialtyStringList.contains(coding.getCode())) {
- radiologist = true;
- break;
- }
- }
- }
- }
-
- // if the Role is right and still practicing, link it to the right Organization
- if(radiologist && !role.getPeriod().hasEnd() && role.getOrganization() != null) {
- var org = (Organization) role.getOrganization().getResource();
-
- if(organizationMap.containsKey(org.getId())) {
- organizationMap.get(org.getId()).addContained(role);
- }
- }
- }
- }
-
- // loop over Organization and keep only those with roles
- for(var org : organizationMap.values()) {
- if(!org.getContained().isEmpty()) {
- goodElements.add(org);
- }
- }
-
- // check if result has a next page
- if (orgBundle.getLink("next")!=null) {
- try {
- orgBundle = client.loadPage().byUrl(orgBundle.getLink("next").getUrl()).andReturnBundle(Bundle.class).execute();
- } catch (Exception e) {
- logger.error("Error getting next page");
- e.printStackTrace();
- hasNext = false;
- }
- } else {
- hasNext = false;
- }
-
- logger.info("Progress treated - {} / {} / {} role(s)", treated, orgBundle.getTotal(), nbRoles);
-} while (hasNext);
-
-logger.info("Total organization - {}", totalElements);
-logger.info("Total radiology - {}", goodElements.size());
-{% endhighlight %}
-
-
-
-
-
-### 2.5) Le couloir Médecine de ville
-
-#### 2.5.1) Définition
-
-
-Ce Couloir est défini par les secteurs d’activité suivants :
-* SA07 ; SA08 ; SA09
-* Pour SA07 ; SA08 ; SA09 avec au moins un PS
- * dont le code profession = 10
- * qui possède un savoir-faire différent de : SM28, SM44, SM45, SM55
-
-**NOS :**
-* Ensemble des professions : [JDV_J106-EnsembleProfession-RASS](https://mos.esante.gouv.fr/NOS/JDV_J106-EnsembleProfession-RASS)
-* Ensemble des savoir-faires : [JDV_J107-EnsembleSavoirFaire-RASS](https://mos.esante.gouv.fr/NOS/JDV_J107-EnsembleSavoirFaire-RASS)
-
-
-
-
-#### 2.5.2) Requête
-
-Afin de récupérer les cabinets de médecins qui ne sont pas des cabinets de radiologie, nous devons interroger l'endpoint Organization :
-
- * En filtrant sur le paramètre de recherche type = SA07, SA08, SA09
- * En incluant les PractitionerRole liés aux Organizations afin de pouvoir filtrer ensuite sur paramètre de recherche speciality
-
-
-
-
-Une fois l’ensemble des données récupéré, procédez aux filtres suivants :
-
-Les PractitionerRoles doivent correspondre à la profession de santé "Médecin" (10) (champs code du PractitionerRole comme le montre le point 3 sur l'image ci-dessous).
-
-Ensuite les PractitionerRoles souhaités ***NE DOIVENT PAS correspondre*** aux spécialités : SM28, SM44, SM45, SM55 (champs specialty du PractitionerRole comme le montre le point 2 sur l'image ci-dessous)
-
-Enfin, il faut regrouper les PractitionerRoles pour les lier aux bonnes Organization (champ organization du PractitionerRole comme le montre le point 1 sur l’image ci-dessous)
-
-Nous pouvons finalement ne récupérer que les Organizations contenant des PractitionerRoleRoles selon les filtres que nous avons appliqués.
-
-
-{:style="max-width:670px"}
-
-
-
-
-
-{% highlight bash %}
-1) Faire un appel sur l'endpoint Organization en filtrant sur les Organization qui ont un type = SA07, SA08 ou SA09.
-Cet appel devra inclure les PractitionerRoles attachés (&_revinclude=PractitionerRole:organization)
-2) Pour chacun des PractitionerRole retournés, vérifier qu'il y a au moins 1 Role (champs role) avec pour :
-- system = "https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_G15-ProfessionSante/FHIR/TRE-G15-ProfessionSante"
-- et un code = 10 (médecin)
-3) Pour chacun des PractitionerRole filtrés, vérifier qu'il ne dispose pas des spécialités de radiologie (champs speciality) avec pour :
-- system = "https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R38-SpecialiteOrdinale/FHIR/TRE-R38-SpecialiteOrdinale"
-- et un code = SM28, SM44, SM45 ou SM55
-4) Pour chacun des PractitionerRole filtrés, vérifier qu'il est toujours en activité
-5) Pour chacun des PractitionerRole trouvés et filtrés, récupérer les Organization qui ont le même id que le champs organization du PractitionerRole
-6) Répeter l'opération sur toutes les pages (1)
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight bash %}
-curl \
- -H "ESANTE-API-KEY: {{site.ans.demo_key }}" \
- "{{site.ans.api_url}}/fhir/Organization?type=SA05%2C%20SA07%2C%20SA08%2C%20SA09%2C%20SA52&_revinclude=PractitionerRole%3Aorganization"
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight java %}
-var client = createClient();
-var hasNext = true;
-Bundle orgBundle = null;
-var totalElements = 0;
-var goodElements = new ArrayList<>();
-var treated = 0;
-var nbRoles = 0;
-
-// construct radiology facility request
-try {
-orgBundle = client.search().forResource(Organization.class)
-.where(Organization.TYPE.exactly().codes("SA07", "SA08", "SA09"))
-.revInclude(PractitionerRole.INCLUDE_ORGANIZATION)
-.returnBundle(Bundle.class).execute();
-
- totalElements = orgBundle.getTotal();
-} catch (Exception e) {
-e.printStackTrace();
-hasNext = false;
-}
-
-logger.info("Total results - {}", orgBundle.getTotal());
-
-do {
-var bundleContent = orgBundle.getEntry();
-var organizationMap = new LinkedHashMap();
-
- for (var e : bundleContent) {
- // store the organization inside a map
- if(e.getResource() instanceof Organization) {
- var org = (Organization) e.getResource();
- organizationMap.put(org.getId(), org);
- treated++;
- }
-
- if(e.getResource() instanceof PractitionerRole) {
- var role = (PractitionerRole) e.getResource();
- var medic = false;
- var radiologist = false;
-
- nbRoles++;
-
- // check if the Role contains a medic
- for(var code : role.getCode()) {
- for(var coding : code.getCoding()) {
- if (coding.getSystem().equals("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_G15-ProfessionSante/FHIR/TRE-G15-ProfessionSante") &&
- coding.getCode().equals("10")) {
- medic = true;
- break;
- }
- }
- }
-
- if(medic) {
- var specialtyStringList = Arrays.asList("SM28", "SM44", "SM45", "SM55");
-
- // if a medic was found, check its specialties to filter only radiologist
- for (var code : role.getSpecialty()) {
- for (var coding : code.getCoding()) {
- logger.info("Specialty Coding {} - {}", coding.getSystem(), coding.getCode());
- if (coding.getSystem().equals("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R38-SpecialiteOrdinale/FHIR/TRE-R38-SpecialiteOrdinale") &&
- specialtyStringList.contains(coding.getCode())) {
- radiologist = true;
- break;
- }
- }
- }
- }
-
- // if the Role is right and still practicing, link it to the right Organization
- if(medic && !radiologist && !role.getPeriod().hasEnd() && role.getOrganization() != null) {
- var org = (Organization) role.getOrganization().getResource();
-
- if(organizationMap.containsKey(org.getId())) {
- organizationMap.get(org.getId()).addContained(role);
- }
- }
- }
- }
-
- // loop over Organization and keep only those with roles
- for(var org : organizationMap.values()) {
- if(!org.getContained().isEmpty()) {
- goodElements.add(org);
- }
- }
-
- // check if result has a next page
- if (orgBundle.getLink("next")!=null) {
- try {
- orgBundle = client.loadPage().byUrl(orgBundle.getLink("next").getUrl()).andReturnBundle(Bundle.class).execute();
- } catch (Exception e) {
- logger.error("Error getting next page");
- e.printStackTrace();
- hasNext = false;
- }
- } else {
- hasNext = false;
- }
-
- logger.info("Progress treated - {} / {} / {} role(s)", treated, orgBundle.getTotal(), nbRoles);
-} while (hasNext);
-
-logger.info("Total organization - {}", totalElements);
-logger.info("Total radiology - {}", goodElements.size());
-{% endhighlight %}
-
-
-
-
-
-### 2.6) Le couloir Officine
-
-#### 2.6.1) Définition
-
-Ce Couloir est défini par les secteurs d’activité suivants : SA33, SA38, SA39, SA56.
-
-**NOS** : Secteurs d’activité [TRE-R02-SecteurActivite](https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R02-SecteurActivite/FHIR/TRE-R02-SecteurActivite/)
-
-
-#### 2.6.2) Requête
-
-Afin de récupérer les officines, nous devons interroger l'endpoint Organization :
-
- En filtrant sur le paramètre type :
- - system = "https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R02-SecteurActivite/FHIR/TRE-R02-SecteurActivite"
- - et code = SA33, SA38, SA39, SA56
-
-
-
-
-Les données récupérées sont déjà pré-filtrées selon notre besoin et ne sont que des officines.
-
-
-
-
-{% highlight bash %}
-1) Faire un appel sur l'endpoint Organization en filtrant sur les Organization ayant un type parmi SA33, SA38, SA39 ou SA56.
-Cet appel devra également inclure le filtre sur le system (&type=https%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R02-SecteurActivite%2FFHIR%2FTRE-R02-SecteurActivite|SA33...)
-2) L'ensembles des Organization récupérées sont des pharmacies
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight bash %}
-curl \
- -H "ESANTE-API-KEY: {{site.ans.demo_key }}" \
- "{{site.ans.api_url}}/fhir/Organization?type=https%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R02-SecteurActivite%2FFHIR%2FTRE-R02-SecteurActivite%7CSA33%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R02-SecteurActivite%2FFHIR%2FTRE-R02-SecteurActivite%7CSA38%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R02-SecteurActivite%2FFHIR%2FTRE-R02-SecteurActivite%7CSA39%2Chttps%3A%2F%2Fmos.esante.gouv.fr%2FNOS%2FTRE_R02-SecteurActivite%2FFHIR%2FTRE-R02-SecteurActivite%7CSA56"
-{% endhighlight %}
-
-
-{% highlight java %}
-var client = createClient();
-var hasNext = true;
-Bundle orgBundle = null;
-var totalElements = 0;
-var treated = 0;
-var goodElements = new ArrayList<>();
-
-// construct radiology facility request
-try {
- var pharmacyCodesList = Arrays.asList("SA33", "SA38", "SA39", "SA56");
- orgBundle = client.search().forResource(Organization.class)
- .where(Organization.TYPE.exactly().systemAndValues("https://mos.esante.gouv.fr/NOS/TRE_R02-SecteurActivite/FHIR/TRE-R02-SecteurActivite", pharmacyCodesList))
- .returnBundle(Bundle.class).execute();
-
- totalElements = orgBundle.getTotal();
-} catch (Exception e) {
- e.printStackTrace();
- hasNext = false;
-}
-
-logger.info("Total results - {}", totalElements);
-
-do {
- var bundleContent = orgBundle.getEntry();
-
- for (var e : bundleContent) {
- // store the organization inside a map
- if(e.getResource() instanceof Organization) {
- var org = (Organization) e.getResource();
- goodElements.add(org);
- treated++;
- }
- }
-
- // check if result has a next page
- if (orgBundle.getLink("next")!=null) {
- try {
- orgBundle = client.loadPage().byUrl(orgBundle.getLink("next").getUrl()).andReturnBundle(Bundle.class).execute();
- } catch (Exception e) {
- logger.error("Error getting next page");
- e.printStackTrace();
- hasNext = false;
- }
- } else {
- hasNext = false;
- }
-
- logger.info("Progress treated - {} / {}", treated, totalElements);
-} while (hasNext);
-
-logger.info("Total organization - {}", goodElements.size());
-{% endhighlight %}
-
-
-
-
-
-
-(1) Plus d'informations sur la pagination [ici]()