Minicurso (15h) mininstrado na XXVII Escola de Verão de Geofísica do IAG - USP.
Instrutores: Leonardo Uieda, Arthur Siqueira de Macêdo, Yago Moreira Castro
Ensinar noções básicas de diversas ferramentas digitais (shell/bash, git, GitHub, make, LaTeX) que podem poupar esforços e frustrações de pesquisadores, alunos e profissionais que lidam com dados (amplamente definido), além de potencializar sua produtividade e a robustez de seus fluxos de trabalho e lhes permitir colaborar em projetos de software livre desenvolvidos pela comunidade.
O curso tem como objetivo difundir o uso de algumas ferramentas computacionais que têm o potencial de facilitar a vida de profissionais e cientistas que lidam com dados e produção de textos técnicos e científicos. As ferramentas podem ser utilizadas em diversos contextos: profissional, ensino, estudos, pesquisa, extensão, etc. O programa do curso será:
- Uso do terminal e de shell scripts: Em qualquer sistema operacional, aprender a utilizar o terminal pode parecer arcaico mas pode ser extremamente eficaz para executar tarefas repetitivas e automatizar conjuntos de operações que são feitas com frequência. Aprender a navegar em um terminal e utilizar a linguagem Bash abrem portas para várias outras ferramentas úteis.
- Controle de versão e colaboração online com git e GitHub: Sistemas de controle de versão, como o git, servem para rastrear mudanças feitas a conjuntos de arquivos. Se utilizadas de maneira correta, podem fornecer fontes de backup e a segurança para alterar o conteúdo de arquivos sem o medo de perder a versão original. Pareados com plataformas online, como o GitHub e GitLab, o uso desses sistemas permite a colaboração em projetos de software, websites e até mesmo artigos, livros e teses.
- Automatização de workflows com Make: O programa Make é amplamente utilizado desde a década de 70 para automatizar fluxos de trabalho. O uso mais comum é para a compilação de códigos complexos, mas seu uso vai muito além disso. Com o Make, é possível automatizar tarefas comuns, como rodar scripts para produzir figuras, criar PDFs a partir de código LaTeX, etc.
- Criação de artigos, livros e teses com LaTeX: O LaTeX é um "typesetting system", que transforma código em PDFs. Embora seja mais trabalhoso de aprender do que softwares como Word, o fato do texto ser escrito em forma de código possui diversas vantagens: o mesmo texto pode ser usado para gerar documentos com temas diferentes, facilidade na utilização de referências cruzadas, geração automática de bibliografia e citações, numeração automática de equações, figuras e capítulos, etc.
O formato do curso conterá: ● Aulas expositivas: Para ensinar uma ferramenta nova, o ministrante realizará uma demonstração ao vivo com os participantes seguindo em seus próprios computadores. ● Exercícios: Intercalado com as aulas expositivas, os participantes receberão pequenos desafios e exercícios para serem realizados individualmente e em grupos. ● Aplicações: O curso reservará parte do tempo para a aplicação das ferramentas ensinadas em problemas trazidos pelos participantes. Essas aplicações podem ser individuais ou compartilhadas com todos os participantes.
Ao final do curso, os participantes saberão como desenvolver projetos complexos em equipe e com fluxos de trabalho automatizados para produção de resultados e relatórios/teses/artigos de alta qualidade. As ferramentas aprendidas também formam a base para melhorar a reprodutibilidade de resultados e para a prática de Ciência Aberta.
Em breve.
- Lição de bash e terminal do Software Carpentry: https://swcarpentry.github.io/shell-novice
- Lição de Python do Software Carpentry: https://swcarpentry.github.io/python-novice-inflammation
- Lição de Make do Software Carpentry: https://swcarpentry.github.io/make-novice
- Lição de git do Software Carpentry: https://swcarpentry.github.io/git-novice
- Lição de LaTeX do Overleaf: https://www.overleaf.com/learn