-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
03-simpleCA.Rmd
564 lines (423 loc) · 18.9 KB
/
03-simpleCA.Rmd
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
# Yksinkertainen korrespondenssianalyysi
**k1** Yksi kysymys, kuusi maata, peruskäsitteet
**k2** Luvun tärkeimmät asiat; mitä on luvassa?
## Äiti töissä -kärsiikö lapsi?
**k1**"Alle kouluikäinen lapsi todennäköisesti kärsii, jos hänen äitinsä käy työssä".
Lyhennän muotoon äiti töissä. ISSP-tutkimuksissa kaksi kysymystä, joissa sana "äiti",
MG havainnut ne poikkeaviksi (**#V ?**).
**zxy** Edellisessä luvussa on esitelyt aineisto, ja kerrottu rajaukset.
```{r esim1data1, echo = FALSE, include = FALSE}
# UUSI DATA 30.1.20
#
# LUETAAN DATA G1_1_data2.Rmd - tiedostossa, luodaan faktorimuuttujat
# G1_1_data_fct1.Rmd-tiedostossa -> ISSP2012jh1d.dat (df)
# 23 muuttujaa (9 substanssimuuttujaa, 8 taustamuuttujaa, 3 maa-muuttujaa, 3 metadatamuuttujaa)
# 25 maata.
# Poistettu 146 havaintoa, joilla SEX tai AGE puuttuu
# Johdattelevassa esimerkissä kuusi maata, kaksi taustamuuttujaa ja yksi kysymys
# (V6/Q1b)
# Kuusi maata
countries_esim1 <- c(56, 100, 208, 246, 276, 348) #BE,BG,DK,FI,DE,HU
ISSP2012esim3.dat <- filter(ISSP2012jh1d.dat, V4 %in% countries_esim1)
# str(ISSP2012esim3.dat) - pitkä listaus pois (24.2.20)
#neljä maamuuttujaa, kysymys Q1b, ikä ja sukupuoli
vars_esim1 <- c("C_ALPHAN", "V3", "maa","maa3", "Q1b", "sp", "ika")
ISSP2012esim2.dat <- select(ISSP2012esim3.dat, all_of(vars_esim1))
str(ISSP2012esim2.dat) # 8542 obs. of 7 variables, ja sama 8.6.2020
# C_ALPHAN: chr, maa: Factor w/ 25
# Poistetaan havainnot, joilla Q1b - muuttujassa puuttuva tieto 'NA'
# sum(is.na(ISSP2012esim2.dat$Q1b)) = 399
ISSP2012esim1.dat <- filter(ISSP2012esim2.dat, !is.na(Q1b))
#str(ISSP2012esim1.dat) # 8143 obs. of 6 variable
# Tarkistuksia (3.2.20)
#
#fct_count(ISSP2012esim1.dat$sp)
#fct_count(ISSP2012esim1.dat$Q1b)
#fct_count(ISSP2012esim1.dat$maa)
#fct_count(ISSP2012esim1.dat$maa3)
#
#summary(ISSP2012esim1.dat$sp)
#sp: 3799 + 4344 = 8143
#summary(ISSP2012esim1.dat$Q1b)
# S s ? e E
# 810 + 1935 + 1367 + 2125 + 1906 = 8143
#
# EDELLINEN DATA - havaintojen määrät samat kuin uudella datalla (31.1.20)
#
# 8557 obs. ennen kuin sexagemissing poistettiin, nyt 8542, 8557-8542 = 15
#
# Poistetaan havainnot joissa puuttuva tieto muuttujassa V6 (Q1b) n = 399
# 8542-399 = 8143
# Tyhjät "faktorilabelit" on poistettava
ISSP2012esim1.dat <- ISSP2012esim1.dat %>%
mutate(maa = fct_drop(maa),
maa3 = fct_drop(maa3)
)
#summary(ISSP2012esim1.dat$maa)
#summary(ISSP2012esim1.dat$maa3)
#
# str(ISSP2012esim1.dat$maa)
# attributes(ISSP2012esim1.dat$maa)
#
# str(ISSP2012esim1.dat$maa3)
# attributes(ISSP2012esim1.dat$maa3)
#
#ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa, Q1b, type = "count")
#fct_count(ISSP2012esim1.dat$Q1b)
# fct_count(ISSP2012esim1.dat$sp)
# fct_unique(ISSP2012esim1.dat$maa)
# fct_count(ISSP2012esim1.dat$maa)
#ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa, C_ALPHAN, type = "count")
#
# maa3 - siistitään "faktorilabelit" kaksikirjaimisiksi
#
# ISO 3166 Code V3 - maiden jaot
# 5601 BE-FLA-Belgium/ Flanders
# 5602 BE-WAL-Belgium/ Wallonia
# 5603 BE-BRU-Belgium/ Brussels
# 27601 DE-W-Germany-West
# 27602 DE-E-Germany-East
# Tähän pitäisi päästä
# levels = c("100","208","246","348","5601","5602","5603","27601","27602"),
# labels = c("BG","DK","FI","HU","bF","bW","bB","dW","dE"))
# levels(ISSP2012esim1.dat$maa3)
ISSP2012esim1.dat <- ISSP2012esim1.dat %>%
mutate(maa3 =
fct_recode(maa3,
"BG" = "BG-Bulgaria",
"DK" = "DK-Denmark",
"FI" = "FI-Finland",
"HU" = "HU-Hungary",
"bF" = "BE-FLA-Belgium/ Flanders",
"bW" = "BE-WAL-Belgium/ Wallonia",
"bB" = "BE-BRU-Belgium/ Brussels",
"dW" = "DE-W-Germany-West",
"dE" = "DE-E-Germany-East")
)
# tarkistuksia
#levels(ISSP2012esim1.dat$maa3)
# str(ISSP2012esim1.dat$maa3) # 9 levels
#summary(ISSP2012esim1.dat$maa3)
#
# TÄSSÄ TOISTOA! (4.2.20)
# Muutetaan muuttujien "maa" ja "maa3" arvojen (levels) järjestys samaksi kuin
# alkuperäisen muuttujan C_ALPHAN. Helpomi verrata aikaisempiin tuloksiin.
# "alkuperäinen" maa talteen
ISSP2012esim1.dat$maa2 <- ISSP2012esim1.dat$maa
ISSP2012esim1.dat <- ISSP2012esim1.dat %>%
mutate(maa =
fct_relevel(maa,
"BE",
"BG",
"DE",
"DK",
"FI",
"HU"))
ISSP2012esim1.dat <- ISSP2012esim1.dat %>%
mutate(maa3 =
fct_relevel(maa3,
"bF",
"bW",
"bB",
"BG",
"dW",
"dE",
"DK",
"FI",
"HU"))
# Tarkistus
#ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa2,maa, type = "count")
# "alkuperäinen" maa talteenISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa,C_ALPHAN, type = "count")
# "alkuperäinen" maa talteenstr(ISSP2012esim1.dat)
```
Tarkistetaan uudet muuttujat (koodilohkon tulostus pois tarvittaessa).
```{r r esim1data2, echo = FALSE, include = FALSE, message=TRUE, warning=TRUE}
# Taulukoita (31.1.2020) ja tarkistuksia
#
# toinen maa-muuttuja, jossa Saksan ja Belgian jako
# V3
# 5601 BE-FLA-Belgium/ Flanders
# 5602 BE-WAL-Belgium/ Wallonia
# 5603 BE-BRU-Belgium/ Brussels
# 27601 DE-W-Germany-West
# 27602 DE-E-Germany-East
# Tarkastuksia
# assert_that ehkä tarpeeton - expect_equivalet testaa levelien
# järjestyksen ja määrän (20.2.20)
validate_that(length(levels(ISSP2012esim1.dat$sp)) == 2)
validate_that(are_equal(levels(ISSP2012esim1.dat$sp),
c("m", "f")))
validate_that(length(levels(ISSP2012esim1.dat$maa)) == 6)
validate_that(are_equal(levels(ISSP2012esim1.dat$maa),
c("BE", "BG", "DE", "DK", "FI", "HU")))
validate_that(length(levels(ISSP2012esim1.dat$maa3)) == 9)
validate_that(are_equal(levels(ISSP2012esim1.dat$maa3),
c("bF","bW","bB", "BG","dW","dE","DK", "FI", "HU")))
validate_that(length(levels(ISSP2012esim1.dat$Q1b)) == 5)
validate_that(are_equal(levels(ISSP2012esim1.dat$Q1b),
c("S", "s", "?", "e", "E")))
# testthat - paketti - pois käytöstä 16.9.20
# expect_ ei anna ok-ilmoitusta, ainoastaan virheilmoituksen? (11.4.20)
# expect_equivalent(levels(ISSP2012esim1.dat$maa),
# c("BE", "BG", "DE", "DK", "FI", "HU"))
# expect_equivalent(levels(ISSP2012esim1.dat$maa3),
# c("bF","bW","bB", "BG","dW","dE","DK", "FI", "HU"))
# expect_equivalent(levels(ISSP2012esim1.dat$sp), c("m", "f"))
# expect_equivalent(levels(ISSP2012esim1.dat$Q1b),
# c("S", "s", "?", "e", "E"))
#
# ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa,ika,type = "row_perc")
#
# Riviprofiilit
#
# ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa,ika,type = "row_perc")
# ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa,sp ,type = "row_perc")
#
#
# Kysymyksen Q1b vastaukset
#
#ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa,Q1b,type = "row_perc")
#
#ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa3,Q1b,type = "row_perc")
#
# str(ISSP2012esim1.dat) # 8143 obs. of 7 variable,
# sama kuin vanhassa Galku-koodissa.
#
# str(ISSP2012esim1.dat) # 8143 obs. of 7 variable,
# sama kuin vanhassa Galku-koodissa.
```
## Kahden muuttujan frekvenssitaulukon analyysi
**k** Kolme taulukkoa: frekvenssitaulukko, riviprosentit ja sarakeprosentit
```{r simpeCA-frekTa1, echo = FALSE}
taulu2 <- ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa, Q1b, type = "count")
knitr::kable(taulu2,digits = 2, booktabs = TRUE,
caption = "Kysymyksen Q1b vastaukset maittain")
```
```{r simpeCA-rprosTa1, echo = FALSE}
taulu3 <- ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa,Q1b,type = "row_perc")
knitr::kable(taulu3,digits = 2, booktabs = TRUE,
caption = "Kysymyksen Q1b vastaukset, riviprosentit")
```
```{r simpeCA-cprosTa1, echo = FALSE}
taulu4 <- ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa,Q1b,type = "col_perc")
knitr::kable(taulu4,digits = 2, booktabs = TRUE,
caption = "Kysymyksen Q1b vastaukset, sarakeprosentit")
```
**k** **Taulkoista**
Ensimmäinen taulukko on data, lukumäärädataa. Toinen ja kolmas kaksi näkökulmaa
samaan taulukkoon. Sarakkeilla ja riveillä on erilainen rooli, tässä riviprosentit
ovat luonteva tapa verrata "riippuvaa muuttujaa", eri maita.
**k** Rivit on saatu alkuperäisestä aineistosta osajoukkojen summina. MG:n
terminologialla "samples".
```{r EkaCA, echo = FALSE, include = FALSE}
# CA tässä, jotta saadaan rivi- ja sarakeprofiilikuvat
# Lasketaan samalla CA-ratkaisu riviprofiilitaulkolle (maille samat painot)
simpleCA1 <- ca(~maa + Q1b,ISSP2012esim1.dat)
# Maiden järjestys kääntää kuvan (1.2.20) - esimerkki on
# vähän kuriositeetti. Kartta voi tietysti "flipata" koordintaattien suhteen ainakin
# neljällä tavalla (? 180 astetta molempien akseleiden ympäri molempiin suuntiin?)
# (18.2.20). Tämän maa2-muuttujaa käyttävän kuvan voi jättää pois (8.4.20)
# simpleCA2 <- ca(~maa2 + Q1b,ISSP2012esim1.dat)
# Oikeastaan maiden vertailussa pitäisi niiden massat skaalata yhtä suuriksi, tässä
# pikainen kokeilu (20.2.20)
# Riviprosentit taulukoksi, nimet sarakkeille ja riveille (ei kovin robustia...)
johdesim1_rowproc.tab <- simpleCA1$N / rowSums(simpleCA1$N)
colnames(johdesim1_rowproc.tab) <- c("S" ,"s" ,"?","e", "E")
rownames(johdesim1_rowproc.tab) <- c("BE", "BG", "DE", "DK", "FI", "HU")
# Miten tibblenä? Ei toimi, ei maa-muuttujaa ollenkaan
# johdesim1_rowproc.tbl <- as_tibble(johdesim1_rowproc.tab)
# str(johdesim1_rowproc.tbl)
# TARKISTUKSIA (20.2.20)
# johdesim1_rowproc.tab
# rowSums(johdesim1_rowproc.tab)
# str(johdesim1_rowproc.tab)
simpleCA3 <- ca(johdesim1_rowproc.tab)
# Kartta piirretään koodilohkossa simpleCAmap1, r. 773 noin.
# Riviprosentit tarkistusta varten
# S s ? e E
#BE 9.49 22.40 21.76 27.42 18.93
#BG 12.81 42.89 22.26 20.63 1.41
#DE 9.63 21.88 11.55 31.39 25.55
#DK 5.04 17.15 10.95 16.71 50.14
#FI 4.23 16.94 13.42 38.11 27.30
#HU 21.97 28.89 22.57 19.06 7.52
#
# Ja datan saa leikepöydän kautta, jos on tarve pikatarkistuksiin
# read <- read.table("clipboard")
```
**Kuvat**
```{r g1-2kuva1, fig.cap = "Q1b:Sarakeprofiilit ja keskiarvoprofiili", echo = FALSE, include = TRUE}
#mutkikas kuvan piirto - sarakeprofiilit vertailussa
#ggplot vaatii df-rakenteen ja 'long data' - muotoon
##https://stackoverflow.com/questions/9563368/create-stacked-barplot
# -where-each-stack-is-scaled-to-sum-to
# Pitkä https-linkki kahdella rivillä
#
# käytetään ca - tuloksia
apu1 <- (simpleCA1$N)
colnames(apu1) <- c("S", "s", "?", "e", "E")
rownames(apu1) <- c("BE", "BG", "DE", "DK", "FI", "HU")
apu1_df <- as.data.frame(apu1)
#lasketan rivien reunajakauma
apu1_df$ka_sarake <- rowSums(apu1_df)
#muokataan 'long data' - muotoon
apu1b_df <- melt(cbind(apu1_df, ind = rownames(apu1_df)), id.vars = c('ind'))
p <- ggplot(apu1b_df, aes(x = variable, y = value, fill = ind)) +
geom_bar(position = "fill", stat = "identity") +
scale_y_continuous(name = " ",labels = percent_format())
p <- p + labs(fill = "maa")
p + scale_x_discrete(name = "Q1b - vastauskategoriat")
# apu1_df
# apu1b_df
```
```{r g1-2kuva2, fig.cap = "Q1b: riviprofiilit ja keskiarvorivi", echo = FALSE, include = TRUE}
# riviprofiilit ja keskiarvorivi - 18.9.2018
apu2_df <- as.data.frame(apu1)
apu2_df <- rbind(apu2_df, ka_rivi = colSums(apu2_df))
#apu2_df
#str(apu2_df)
## typeof(apu2_df) # what is it?
## class(apu2_df) # what is it? (sorry)
## storage.mode(apu2_df) # what is it? (very sorry)
## length(apu2_df) # how long is it? What about two dimensional
## objects?
# attributes(apu2_df)
# temp1 <- cbind(apu2_df, ind = rownames(apu2_df))
# temp1
##muokataan 'long data' - muotoon
apu2b_df <- melt(cbind(apu2_df, ind = rownames(apu2_df)), id.vars = c('ind'))
# str(apu2b_df)
# glimpse(apu2b_df)
#
#ggplot(apu2b_df, aes(x = value, y = ind, fill = variable)) +
# geom_bar(position = "fill", stat ="identity") +
# #coord_flip() +
# scale_x_continuous(labels = percent_format())
#versio2 toimii (18.9.2018)
p <- ggplot(apu2b_df, aes(x = ind, y = value, fill = variable)) +
geom_bar(position = "fill", stat = "identity") +
coord_flip() +
scale_y_continuous(name = " ",labels = percent_format())
p <- p + labs(fill = "Q1b")
p + scale_x_discrete(name = " ")
```
## CA - esimerkki
```{r simpleCA1map1, echo=FALSE, fig.cap= "Q1b: lapsi kärsii jos äiti on töissä",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
# simpleCA1 luotu aikaisemmin profiilikuvia varten koodilohkossa EkaCA
# HUOM! xlab ja ylab, prosenttiosuudet ensin katsottu ja sitten kirjoitettu
# tässä. Vertaa scree-plot - tietoon!
par(cex = 1)
plot(simpleCA1, map = "symmetric", mass = c(TRUE,TRUE),
xlab = "Dimensio 1: moderni/liberaali - perinteinen/konservatiivinen (76%)",
ylab = "Dimensio 2: maltillinen/epävarma - radikaali/jyrkkä/varma (15.1%)",
main = "symmetrinen kartta 1",
sub = "Maiden massat eri suuruisia (otoskoko), pisteiden koko suhteessa massaan")
```
**edit1** jatkossa plot - main on kuvan tyyppi (symmetrinen, kontribuutio jne),
koodilohkon fig.cap "ylimmän tason" otsikko.
**edit2** Akseleiden tekstit (Dimensio 1....jne) asetettu käsin, ikävä kyllä myös
selitetyn inertian osuus. Ainakin tästä ensimmäisestä kuvasta ne kannattaa jättää
pois, spoileri!
**edit3** par(cex = 1) ennen plot-komenota muuttaa valitettavasti "kaiken" kokoa.
Antaa olla, kun on graafista data-analyysiä. Selkeys tärkeämpää kuin ulkoasu.
**k** Kartan tulkinta
**k** Prosentit - kuinka paljon kokonaisinertiasta saadaan kuvattua ("selitettyä").
**k** Dimenisoiden tulkinta sarakepisteiden avulla: mitä on oikealla ja vasemmalla?
Kaukana on kaukana, mutta lähellä voi olla täydessä sarake- tai riviavaruudessa
kaukana. Siksi tulkinta kontrastien avulla - mikä piste on suhteellisesti kauimpana?
**k** Rivipisteiden tulkinta kartalla - järjestys vasemmalta oikealle ja alhaalta
ylös. Pisteiden etäisyydet toisistaan.
**k** Origo on aineiston keskipiste, "riippumattomuushypoteesi" (kts. teorialiite).
**k** Sarakepisteiden erot ja rivipisteiden erot ovat suhteellisia, approksimoivat
khii2-etäisyyksiä.
**k** Rivi- ja sarakepisteiden etäisyyksillä ei suoraan mitään tulkintaa!
**k** Lista: mitä muuta, johon palataan seuraavassa luvussa?
- kuinka hyvin pisteet on esitetty tasossa?
- esim. x-akseli kuvaa ("nappaa") 76% kokonaisinertiasta. Pisteiden
inertiakontribuutiot
## Korrespondenssianalyysin peruskäsitteet
**ks** Mitä käsitteitä tässä esitellään? Viittaukset teorialiitteeseen, ja
tulkinnan hankaluudet (MG "loose ends" - paperi) käsitellään siellä.
**edit** Sulava kuvaus tulkinnasta, painotus kuvien tulkinnassa. CA:n numeeriset
tulokset vasta seuraavassa luvussa. Tässä "mitä kuvasta näkee", ei muuta (paitsi
varoitukset - mitä ei näe). Idea koko ajan taulukon sarakkeiden ja riveien yhteyksien
visualisointi.
**edit** Tärkeää selkeä kuvaus pääkoordinaattien ja standardikoordinaattien
suhteesta. Tarkemmin teorialiitteessä, tässä heuristisesti jotta kuvia osaa tulkita.
### Asymmetrinen kartta ja ideaalipisteet
```{r G1-3asymm2,echo = FALSE, fig.cap= "Q1b: lapsi kärsii jos äiti on töissä",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
# asymmetrinen kartta - rivit pc ja sarakkeet sc
# sarakkeet vektorikuvina
par(cex = 0.7)
plot(simpleCA1, map = "rowprincipal",
arrows = c(FALSE,TRUE),
main = "asymmetrinen kartta 1"
)
```
**Barysentrinen periaate**
**edit** kuva ei ehkä tarpeen? Tehdään vähän pienempi (out.width = 70%, muuten 90%).
```{r G1-3asymm3,echo = FALSE,fig.cap= "Q1b: lapsi kärsii jos äiti on töissä",fig.asp = 1, out.width = "70%",fig.align = "center"}
# Piirretään Suomen riviprofiilista janat sarakepisteisiin - barysentinen keskiarvo
# Rivipisteet pääkoordinaatteina (principal coordinates)
simpleCA1.rpc <- simpleCA1$rowcoord %*% diag(simpleCA1$sv)
# X11()
par(cex = 1)
plot(simpleCA1, map = "rowprincipal",
arrows = c(FALSE,FALSE),
# main = "barysentrinen periaate - asymmetrinen kartta 2",
sub = "Suomen profiili sarakkeiden barysentrisenä keskiarvona")
segments(simpleCA1.rpc[5,1],simpleCA1.rpc[5,2],simpleCA1$colcoord[, 1],
simpleCA1$colcoord[, 2], col = "pink")
```
**edit** Perustelu kuvalle: barysentrinen periaate on kuvien tulkinnassa ydinasioita.
**Akseleiden tulkinta** tai tulkinnan varmistaminen akseli kerrallaan. Ortogonaaliset
projektion piirretty käsin, havainnollistetaan periaatetta.
```{r G1_3_asymmtulk2, echo = FALSE, out.width='90%', fig.align='center'}
knitr::include_graphics('img/simpleCAasymmTulk2.png')
```
## Kontribuutiot kartalla
Kaksi kuvaa, joissa pisteiden massat on kuvattu pisteiden koolla (ei juuri eroa
huomaa) ja rivi- ja sarekepisteiden kontribuutiot värisävyllä. Mitä tummempi sitä
suurempi kontribuutio. Absoluuttiset ja suhteelliset kontribuutiot.
**edit** Pitäisikö kuvissa olla aina toinen absolute, toinen relative? Selvitetään
teorialiittessä?
Toinen kuva riittää, tässä esitellään kartta jossa on eniten informaatiota.
**Absoluuttiset kontribuutiot** Oletuspistekoko ok, mutta html- ja pdf-tulostus
on erilainen!
```{r G1-3asymmContrib1,echo = FALSE,fig.cap= "Q1b: lapsi kärsii jos äiti on töissä",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
#par(cex = 0.6)
plot(simpleCA1, map = "rowgreen",
contrib = c("absolute", "absolute"),
mass = c(TRUE,TRUE),
arrows = c(FALSE, TRUE),
main = "kontribuutiokartta 1",
sub = "sarakevektorin ja rivipisteiden värin tummuus = absoluuttinen kontribuutio")
```
**Suhteelliset kontribuutiot** Oletuspistekoko ok.
```{r G1-3asymmContrib2,echo = FALSE,fig.cap= "Q1b: lapsi kärsii jos äiti on töissä",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
#par(cex = 0.7)
plot(simpleCA1, map = "rowgreen",
contrib = c("relative", "relative"),
mass = c(TRUE,TRUE),
arrows = c(FALSE, TRUE),
main = "kontribuutiokartta 2",
sub = "sarakevektorin ja pisteen värin tummuus = suhteellinen kontribuutio")
```
## Massat
**edit3** Onko vakioitujen massojen kartta liian aikaisin? Tämä ei ole pääasia, vaan selvennys.
Miksi tässä? Perusteltava, miksi en vakioi massoja maille, sukupuolille jne. (a)
perusteltua kun tarkempi tutkimusongelma, esim. erottelut maiden ja sukupuolten
välillä. Varianssianalyysin tapaan varianssin hajoittaminen ryhmisen sisäiseen ja
ryhmien väliseen. Kts. teorialiitteestä esim. ABBA. (b) CA "perusmuodossa", massa
on yksi kolmesta tärkeimmästä käsitteestä. (c) on aika työlästä!
**edit4** Galkussa verrattu molempien painotusten khii2-etäisyyksiä, jos tarpeen
niin teoria-liitteeseen.
```{r simpleCA3map1, echo=FALSE, fig.cap= "Q1b: lapsi kärsii jos äiti on töissä",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
# Sama kartta - maiden massat vakiotu - simpleCA3 luotu koodilohkossa EkaCA
# CA:n lähtötietona riviprofiilit
par(cex = 0.6)
plot(simpleCA3, map = "symmetric", mass = c(TRUE,TRUE),
main = "symmetrinen kartta 2 ",
sub = "Maidet massat vakioitu (riviprofiilidata)")
```
Ei kovin isoja eroja, tässä datassa.