-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
04-simpleCAlaaj1.Rmd
196 lines (135 loc) · 6.41 KB
/
04-simpleCAlaaj1.Rmd
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
# Yksinkertaisen korrespondenssianalyysin laajennuksia 1 - täydentävät pisteet
**edit** Edellisssä luvussa selitetty barysentrinen keskiarvopiste;
teorialiitteessä hieman laveammin.
**edit** CA:n joustava käyttö vaatii matriisioperaatioita, ja muuta datan rakenteen
muokkausta (rivien lisääminen input-dataan jne.).
## Täydentävät pisteet (supplementary points)
Tekstistä oma dokkari, eri käyttötapaukset lyhyesti. Edellisen luvun asymmetrisen
kartan avulla perustellaan, miten pisteitä voidaaan lisätä.
## Saksan ja Belgian alueet
**Data ja taulukko aluejaosta**
```{r BeDeAluedat1, eval=T, include=F}
# (26.10.20) TÄSSÄ EHKÄ VIRHE - PDF-renderöinti antaa virheilmoituksen?
# Ei todennäköistä, sillä toimii html-tulostuksessa. Kokeiltiin tämän lohkon
# poistamista, ei auttanut ratkaisevasti.
# Belgian ja Saksan aluejako maa3-muuttujassa
# str(ISSP2012esim1.dat$maa3)
# attributes(ISSP2012esim1.dat$maa3)
suppoint1_df1 <- select(ISSP2012esim1.dat, maa3,Q1b)
# Taulukoksi jotta saadaan lisättyä Saksan ja Belgian maa-profiilit täydentäviksi
# pisteiksi.
suppoint1_tab1 <- table(suppoint1_df1$maa3, suppoint1_df1$Q1b)
# Maaprofiilit
suppoint2_df <- filter(ISSP2012esim1.dat, (maa == "BE" | maa == "DE"))
suppoint2_df <- select(suppoint2_df, maa, Q1b)
#glimpse(suppoint2_df)
suppoint2_tab1 <- table(suppoint2_df$maa, suppoint2_df$Q1b)
suppoint2_tab1 # tarkistus 1
# Huom! tämä komento vain kerran - tai koko Rmd-tiedosto uudestaan (17.10.20)
suppoint2_tab1 <- suppoint2_tab1[-c(2,4:6) ,]
#suppoint2_tab1 # tarkistus 2
# lisätään rivit maa3-muuttujan taulukkoon
suppoint1_tab1 <- rbind(suppoint1_tab1, suppoint2_tab1)
suppoint1_tab1 # tarkistus 3
# Testailua pdf-ongelman ratkaisemiseksi - tallennetaa taulukko tiedostoksi
# Ei ratkaisevasti auttanut (26.10.2020)
# write_rds(suppoint1_tab1,"suppoint1tab1.rds")
```
Taulukko, Saksan ja Belgian alueet ja maaprofiilit.
```{r BeDealueTable1, echo=F, eval=TRUE}
# riviprofiilitaulukko aiheuttaa virheen PDF-tulostuksessa
#
# Kts. edellinen koodilohko - testailua pdf-ongelman ratkaisemiseksi
# tallennetaan data tiedostoon, koodilohko BeDeAluedat1 passiviseksi
# suppoint1_tab1 <- read_rds("suppoint1tab1.rds")
# suppoint1_tab1 # tarkistus ok
BeDealueTable <- ISSP2012esim1.dat %>% tableX(maa3, Q1b, type = "row_perc")
knitr::kable(BeDealueTable , digits = 2, booktabs = TRUE,
caption = "Q1b vastaukset, Saksan ja Belgian alueet")
# Q1b vastaukset, Saksan ja Belgian alueet
# S s ? e E Total
# bF 5.04 23.81 25.89 30.83 14.43 100.00
# bW 10.82 21.02 18.57 24.08 25.51 100.00
# bB 17.03 20.94 16.63 23.87 21.53 100.00
# BG 12.81 42.89 22.26 20.63 1.41 100.00
# dW 11.40 26.82 11.83 32.13 17.82 100.00
# dE 5.85 11.33 10.97 29.80 42.05 100.00
# DK 5.04 17.15 10.95 16.71 50.14 100.00
# FI 4.23 16.94 13.42 38.11 27.30 100.00
# HU 21.97 28.89 22.57 19.06 7.52 100.00
# All 9.95 23.76 16.79 26.10 23.41 100.00
```
**edit** Riviprofiilitaulukko, kuvataan alueiden eroja. CA-analyysi kuitenkin koko
aineiston frekfvenssitaululla, jossa rivien massat eivät ole samat.
```{r BeDealueetCA2, echo=FALSE}
suppointCA2 <- ca(suppoint1_tab1[,1:5], suprow = 10:11)
```
### Symmetrinen kartta
```{r suppointCA2map1, echo=FALSE, fig.cap= "Q1b: Saksan ja Belgian aluejako ",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
# par(cex = 0.6)
plot(suppointCA2, main = "Symmetrinen kartta 1 ",
# mass = c(TRUE, TRUE),
# contrib = c(TRUE, TRUE),
sub = "Täydentävät pisteet DE ja BE" )
```
**k** Maaåpisteet alueiden barysentrinen keskiarvo. Tulkinta.
```{r suppointCA2map2, echo=FALSE, fig.cap= "Q1b: Saksan ja Belgian aluejako ",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
plot(suppointCA2, main = "kontribuutiokartta ",
map = "rowgreen",
arrows = c(FALSE, TRUE),
mass = c(TRUE, FALSE),
contrib = c("absolute","absolute"),
sub = "Täydentävät pisteet DE ja BE" )
```
**k** Kontribuutiokartta, kontribuutio värisävyinä ja massat pisteiden kokona.
Yleiskuvaan riittävä, ei kovin selkeä yksityiskohdissa. Motivaatio seuraavalle
jaksolle.Skaalataan asymmetrisen kuvan sarakevektoreita (jotka standardikoordinaateissa)
hieman lähemmäs origoa.
**k** Kaukana on kaukana, mutta lähellä voi olla myös kaukana.
## CA:n numeeriset tulokset
**edit** Teorialiitteessä selitetään tarkemmin numeeristen tulosten tausta, tässä
apuneuvo (a) kuvan tulkinnan varmistamiseen ja (b) approksimaation laadun
tarkistamiseen.
```{r suppointCA2numres1,echo=TRUE}
suppointCA2
```
**k** Lyhyt selostus - nämä aika selkeitä
```{r suppointCA2numres2,echo=TRUE}
summary(suppointCA2)
```
**k** Tulosteen käsitteiden esittely - tavoite kuvan laadun varmistus, akselien
tulkinnan tarkistus. Tarkemmin teorialiitteessä. Tästä pitäisi nähdä, miksi seuraavat
kartat ovat sellaisia kuin ovat.
## Esimerkki 3d- kartasta - Saksan ja Belgian dimensiot
**k** Ei kovin hyviä kuvia, mutta periaate on tärkeä. Kartta on approksimaatio,
pitää päättää milloin se on tarpeeksi hyvä. Tai mille pisteille hyvä, mille huonompi.
**edit 26.10.2020** summary-funktio ei toimi, kun dimensioita CA-ratkaisussa kolme.
Numeeriset tulokset voisi laskea "käsityönä". Kehno kvalitetti 2d-ratkaisussa saa
kuvissa selityksen.
```{r BeDealueetCA3d, echo=TRUE}
suppointCA3 <- ca(~maa3 + Q1b,ISSP2012esim1.dat, nd = 3)
# summary(suppointCA3)
# Error in rsc %*% diag(sv) : non-conformable arguments
```
**Kolme karttaa**
```{r suppointCA3map1, echo=FALSE, fig.cap= "Q1b: Saksan ja Belgian aluejako ",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
plot(suppointCA3, dim = c(1,2),
main = "Kolmen dimension ratkaisu",
sub = "symmetrinen kartta - 1. ja 2. dimensio")
```
```{r suppointCA3map2, echo=FALSE, fig.cap= "Q1b: Saksan ja Belgian aluejako ",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
plot(suppointCA3, dim = c(1,3),
main = "Kolmen dimension ratkaisu",
sub = "symmetrinen kartta - 1. ja 3. dimensio")
```
```{r suppointCA3map3, echo=FALSE, fig.cap= "Q1b: Saksan ja Belgian aluejako ",fig.asp = 1, out.width = "90%",fig.align = "center"}
plot(suppointCA3, dim = c(2,3),
main = "Kolmen dimension ratkaisu",
sub = "symmetrinen kartta - 2. ja 3. dimensio")
```
**k** Tulkinta.
**k** kokeilu 3d-grafiikalla - toinen riittää
```{r 3dklippi1, echo=FALSE}
knitr::include_graphics('img/3dSymMap_1.PNG')
knitr::include_graphics('img/3dSymMap_2.PNG')
```