Fixed test error

src/GSvar/MainWindow.cpp

@@ -1169,6 +1169,7 @@ void MainWindow::on_actionDebug_triggered()
 		*/
 
 		//search for SVs with breakpoints inside genes matching the phenotype
+		/*
 		NGSD db;
 		QSharedPointer<QFile> file = Helper::openFileForWriting("C:\\Marc\\large_sv_breakpoints.tsv");
 		QTextStream ostream(file.data());
@@ -1281,6 +1282,7 @@ void MainWindow::on_actionDebug_triggered()
 			}
 			ostream2 << ps << "\t" << hpos.join(", ") << "\t" << pheno_genes.count() << "\t" << roi.baseCount() << "\t" << c_svs_nofilter << "\t" << svs.count() << "\t" << c_snv_in_roi << endl;
 		}
+		*/
 	}
 	else if (user=="ahgscha1")
 	{

src/cppNGSD-TEST/data_out/germline_report1.html

@@ -55,7 +55,7 @@ <h4>Technischer Report zur bioinformatischen Analyse</h4>
 <p><b>Filterkriterien </b>
 <br />&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;- Allele frequency &le; 1.00%
 <br />Gefundene Varianten in Zielregion gesamt: 319
-<br />Anzahl Varianten ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 0
+<br />Anzahl SNVs/InDels ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 0
 <br />Anzahl CNVs ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 0
 <br />Anzahl SVs ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 0
 </p>

src/cppNGSD-TEST/data_out/germline_report2.html

@@ -61,7 +61,7 @@ <h4>Technischer Report zur bioinformatischen Analyse</h4>
 <p><b>Filterkriterien </b>
 <br />&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;- Allele frequency &le; 1.00%
 <br />Gefundene Varianten in Zielregion gesamt: 135
-<br />Anzahl Varianten ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 2
+<br />Anzahl SNVs/InDels ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 2
 <br />Anzahl CNVs ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 2
 <br />Anzahl SVs ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 3
 </p>

src/cppNGSD-TEST/data_out/germline_report4.html

@@ -61,7 +61,7 @@ <h4>Technischer Report zur bioinformatischen Analyse</h4>
 <p><b>Filterkriterien </b>
 <br />&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;- Allele frequency &le; 1.00%
 <br />Gefundene Varianten in Zielregion gesamt: 135
-<br />Anzahl Varianten ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 2
+<br />Anzahl SNVs/InDels ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 2
 <br />Anzahl CNVs ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 2
 <br />Anzahl SVs ausgew&auml;hlt f&uuml;r Report: 3
 </p>

src/cppNGSD/GermlineReportGenerator.cpp

@@ -1422,7 +1422,7 @@ QString GermlineReportGenerator::trans(const QString& text)
 		de2en["Phänotyp"] = "Phenotype information";
 		de2en["Filterkriterien"] = "Criteria for variant filtering";
 		de2en["Gefundene Varianten in Zielregion gesamt"] = "Variants in target region";
-		de2en["Anzahl Varianten ausgewählt für Report"] = "Variants selected for report";
+		de2en["Anzahl SNVs/InDels ausgewählt für Report"] = "SNVs/InDels selected for report";
 		de2en["Anzahl CNVs ausgewählt für Report"] = "CNVs selected for report";
 		de2en["Anzahl SVs ausgewählt für Report"] = "SVs selected for report";
 		de2en["Anzahl anderer Varianten ausgewählt für Report"] = "Other variants selected for report";

src/cppREST/SslServer.cpp

@@ -1,6 +1,6 @@
 #include "SslServer.h"
 
-SslServer::SslServer(QObject *parent, bool insecure) :
+SslServer::SslServer(QObject *parent) :
 	QTcpServer(parent)
 {
 	current_ssl_configuration_ = QSslConfiguration::defaultConfiguration();

src/cppREST/SslServer.h

@@ -15,7 +15,7 @@ class CPPRESTSHARED_EXPORT SslServer : public QTcpServer
     Q_OBJECT
 
 public:
-	SslServer(QObject *parent = nullptr, bool insecure = false);
+	SslServer(QObject *parent = nullptr);
 	virtual ~SslServer();
 	QSslConfiguration getSslConfiguration() const;
 	void setSslConfiguration(const QSslConfiguration &ssl_configuration);

src/tools.pro

@@ -517,3 +517,4 @@ NGSDExportStudyGHGA.depends = cppNGSD
 
 SUBDIRS += VcfSubstract
 tools-TEST.depends += VcfSubstract
+VcfSubstract.depends = cppNGS