forked from pcingola/SnpEff
-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
test_04_TestCasesEff.csv
We can make this file beautiful and searchable if this error is corrected: It looks like row 2 should actually have 1 column, instead of 2 in line 1.
249 lines (205 loc) · 34.9 KB
/
test_04_TestCasesEff.csv
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
# Summary table
Name , Value
Genome , testHg3770Chr22
Date , 2022-04-19 11:10
SnpEff_version , SnpEff 5.1c (build 2022-04-19 10:57), by Pablo Cingolani
Command_line_arguments , SnpEff -csvStats test_04_TestCasesEff.csv testHg3770Chr22 tests/integration/eff/eff_sort.vcf
Warnings , 1096
Number_of_lines_in_input_file, 1205
Number_of_variants_before_filter, 1242
Number_of_not_variants , 0
Number_of_variants_processed , 1242
Number_of_known_variants (i.e. non-empty ID) , 1242, 100%
Number_of_effects , 9793
Genome_total_length ,51304566
Genome_effective_length ,51304566
Change_rate , 41308
# Change rate by chromosome
Chromosome , Length , Changes , Change_rate
22 , 51304566 , 1242 , 41308
# Variantss by type
Type , Count , Percent
DEL , 32 , 2.57649%
INS , 18 , 1.449275%
SNP , 1192 , 95.974235%
# Effects by impact
Type , Count , Percent
HIGH , 97 , 0.990503%
LOW , 1058 , 10.803635%
MODERATE , 1179 , 12.039212%
MODIFIER , 7459 , 76.16665%
# Effects by functional class
Type , Count , Percent
MISSENSE , 1162 , 55.784926%
NONSENSE , 35 , 1.680269%
SILENT , 886 , 42.534806%
Missense_Silent_ratio, 1.311512
# Count by effects
Type , Count , Percent
3_prime_UTR_variant , 226 , 2.259322%
5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant , 20 , 0.19994%
5_prime_UTR_variant , 111 , 1.109667%
TF_binding_site_variant , 5 , 0.049985%
conservative_inframe_deletion , 16 , 0.159952%
disruptive_inframe_deletion , 5 , 0.049985%
downstream_gene_variant , 736 , 7.357793%
frameshift_variant , 41 , 0.409877%
initiator_codon_variant , 2 , 0.019994%
intron_variant , 3881 , 38.79836%
missense_variant , 1158 , 11.576527%
non_coding_transcript_exon_variant , 1316 , 13.156053%
sequence_feature , 5 , 0.049985%
splice_acceptor_variant , 9 , 0.089973%
splice_donor_variant , 10 , 0.09997%
splice_region_variant , 191 , 1.909427%
start_lost , 2 , 0.019994%
stop_gained , 35 , 0.349895%
synonymous_variant , 886 , 8.857343%
upstream_gene_variant , 1348 , 13.475957%
# Count by genomic region
Type , Count , Percent
DOWNSTREAM , 736 , 7.515572%
EXON , 3418 , 34.902481%
INTRON , 3746 , 38.251813%
MOTIF , 5 , 0.051057%
SPLICE_SITE_ACCEPTOR , 9 , 0.091902%
SPLICE_SITE_DONOR , 10 , 0.102114%
SPLICE_SITE_REGION , 159 , 1.623609%
TRANSCRIPT , 5 , 0.051057%
UPSTREAM , 1348 , 13.764934%
UTR_3_PRIME , 226 , 2.307771%
UTR_5_PRIME , 131 , 1.33769%
# Quality
Values , 30,32,38,41,42,44,54,63,66,72,73,74,79,84,87,88,97,101,102,109,112,114,115,116,120,121,122,124,125,126,129,133,137,138,139,143,144,146,147,148,151,155,156,158,160,172,173,176,178,180,181,187,191,195,196,198,200,202,206,210,217,219,221,222,225,226,230,231,232,234,235,237,241,242,248,253,256,261,262,263,264,271,274,275,284,285,288,291,292,293,295,297,298,304,311,314,325,326,328,330,331,333,337,338,344,345,346,347,349,354,356,357,358,360,361,364,366,367,368,372,373,374,375,376,382,384,385,386,387,392,393,394,395,397,398,400,403,404,405,407,408,410,412,416,420,421,423,424,436,438,441,442,443,446,448,450,452,458,463,465,468,469,475,477,481,482,483,484,487,489,490,492,500,501,505,508,511,512,513,514,515,521,524,528,532,537,538,540,543,544,548,551,552,553,554,556,557,558,560,563,567,568,570,572,574,576,577,578,579,580,589,596,602,603,604,605,610,611,612,613,615,616,617,618,619,620,623,626,628,629,632,635,636,637,639,644,648,650,653,657,663,666,667,671,678,679,680,686,689,692,695,696,697,698,699,701,702,705,711,712,716,717,720,722,723,728,729,737,738,739,741,749,750,751,752,753,758,759,764,776,786,788,790,806,808,814,815,818,819,831,837,842,843,844,848,849,850,853,854,861,868,870,874,881,884,887,890,891,893,894,897,908,909,915,919,921,924,925,926,927,928,935,938,939,942,946,948,950,953,954,956,957,958,959,962,966,969,974,976,981,982,985,994,997,1000,1002,1003,1006,1008,1009,1010,1011,1014,1015,1017,1022,1023,1027,1030,1035,1037,1038,1039,1046,1047,1048,1052,1053,1058,1061,1065,1074,1075,1076,1077,1079,1082,1086,1088,1091,1096,1106,1108,1114,1115,1116,1118,1120,1124,1127,1128,1135,1137,1141,1143,1144,1147,1150,1152,1153,1156,1157,1163,1167,1171,1174,1176,1177,1182,1192,1197,1199,1203,1205,1209,1217,1219,1222,1223,1224,1228,1229,1231,1237,1241,1246,1253,1260,1264,1266,1271,1275,1278,1289,1293,1296,1297,1300,1304,1305,1306,1308,1309,1313,1316,1318,1320,1328,1334,1335,1347,1350,1358,1369,1375,1379,1395,1403,1404,1409,1413,1414,1415,1422,1424,1425,1426,1429,1431,1432,1437,1438,1440,1448,1450,1452,1458,1459,1462,1463,1466,1469,1476,1480,1490,1494,1495,1514,1516,1522,1535,1541,1543,1546,1547,1557,1558,1560,1562,1579,1581,1590,1595,1601,1605,1606,1609,1618,1620,1626,1635,1636,1646,1648,1658,1660,1663,1664,1668,1674,1677,1679,1681,1684,1685,1691,1700,1707,1709,1711,1723,1724,1738,1742,1750,1754,1758,1767,1770,1771,1772,1774,1781,1784,1792,1808,1815,1818,1819,1829,1848,1861,1866,1873,1874,1886,1894,1908,1920,1928,1930,1931,1941,1942,1959,1966,1970,1973,1992,1996,2002,2005,2011,2030,2043,2068,2077,2081,2105,2112,2115,2116,2120,2124,2127,2138,2142,2148,2159,2161,2162,2172,2184,2189,2194,2214,2220,2231,2232,2233,2235,2236,2240,2243,2254,2261,2267,2269,2272,2275,2279,2285,2309,2323,2333,2341,2351,2357,2359,2360,2365,2368,2373,2374,2385,2391,2398,2408,2419,2434,2441,2444,2465,2499,2500,2505,2521,2564,2577,2580,2582,2585,2609,2642,2652,2658,2670,2679,2680,2682,2683,2684,2685,2701,2704,2722,2736,2768,2771,2812,2814,2865,2899,2927,2944,2947,2956,2969,2975,2978,2995,2998,3064,3074,3109,3112,3126,3130,3139,3162,3163,3164,3175,3193,3196,3202,3225,3246,3270,3273,3279,3294,3303,3325,3328,3330,3338,3349,3368,3402,3420,3421,3499,3506,3508,3518,3533,3547,3554,3572,3593,3602,3622,3636,3652,3657,3677,3681,3687,3700,3702,3709,3713,3727,3749,3758,3773,3777,3794,3798,3806,3827,3846,3848,3870,3889,3910,3924,3926,3975,3984,3987,3994,3996,4001,4015,4023,4038,4043,4064,4098,4180,4182,4189,4223,4261,4273,4308,4359,4369,4385,4407,4453,4502,4508,4563,4575,4675,4741,4762,4775,4887,4946,4960,5097,5112,5115,5129,5184,5197,5204,5290,5302,5309,5349,5365,5386,5402,5492,5523,5532,5539,5552,5596,5627,5675,5686,5706,5781,5817,5843,5885,5900,5924,6002,6074,6080,6085,6157,6171,6193,6236,6283,6341,6382,6384,6467,6470,6505,6600,6634,6670,6749,6777,6840,6849,6866,6894,6899,6904,6969,6979,6994,7007,7025,7044,7128,7164,7187,7214,7333,7353,7367,7383,7384,7436,7462,7486,7626,7709,7770,7813,7895,7908,8079,8100,8147,8168,8192,8259,8300,8415,8465,8628,8649,8677,8743,8744,8868,8891,8964,8971,9087,9156,9167,9375,9477,9487,9527,9690,9709,9851,9954,9965,10006,10164,10215,10280,10310,10322,10366,10474,10580,10646,10765,10797,11191,11233,11498,11533,11568,11586,11834,11840,11987,12739,12855,13177,13919,13991,14161,14351,14356,14813,15002,15118,15405,15507,15510,15691,16113,16181,16495,16626,16965,17540,17774,17921,17985,18130,18571,18658,18754,18836,18843,19023,19160,19232,19370,19516,19545,19986,20154,20345,20427,20520,20810,20848,20925,21524,21964,22110,22134,22610,22824,23238,23659,24326,24956,24988,26629,28078,28288,28289,29763,31008,31123,31495,32869,33220,34386,36372,36374,36414,37080,37466,38657,40365,40911,41361,42798,42857,44448,48758,52939,53057,57675,64652,66762,67003,69389,70623,74721,75502,75528,76085,78388,78774,81601,86142,87319,91880,99733,101812,102813,103242,104358,107049,107621,108105,108974,110978,113445,119843,120183,121850,126511,128208,131098,134860,137472,145199,147256,151712,173662,185861,189465,191692,195723,198284,213817,214929,217724,223883,228849,249432,259871,335576,354952,356590,393990,439404,454022,491849,533167,534549,597578,608478,887135,1026453,1215997,1342973,1347172,1487213,1496509,1571834,1797684,1835555,2038757,2130746,2387863,3364884,4534089,6379405,7244556,7593998,10062296,10491494,10730943,15364178,16460112,17369887,17454688,24657192,27664018,36532826,2147483647
Count , 1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,3,2,2,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,2,1,1,2,2,1,1,1,1,1,1,2,1,2,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,2,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,3,3,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,3,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,3,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,2,2,2,1,2,1,1,2,2,1,1,2,1,1,1,1,1,3,1,1,1,2,2,1,1,1,1,1,1,2,1,2,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,2,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,2,2,2,1,2,1,1,1,2,4,1,1,2,1,2,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,3,1,2,1,1,1,1,2,1,1,2,2,1,1,1,2,1,1,1,1,1,2,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,2,1,2,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,2,3,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,2,2,1,1,1,1,1,1,1,3,1,1,2,1,1,1,3,3,1,1,1,1,1,2,2,2,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,3,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,2,1,1,1,1,2,1,2,1,1,1,1,1,1,2,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,2,1,2,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,6
# InDel lengths
Values , 0,1,2,4,5
Count , 14,33,1,1,1
# Base changes
base , A , C , G , T
A , 0 , 21 , 88 , 13
C , 67 , 0 , 35 , 382
G , 373 , 62 , 0 , 31
T , 20 , 77 , 23 , 0
# Ts/Tv summary
Transitions , 891
Transversions , 238
Ts_Tv_ratio , 3.743697
# Ts/Tv : All variants
Sample ,Total
Transitions ,891,891
Transversions ,238,238
Ts/Tv ,3.744,3.744
# Ts/Tv : Known variants
Sample ,Total
Transitions ,891,891
Transversions ,238,238
Ts/Tv ,3.744,3.744
# Allele frequency
# Allele frequency : All variants
Values ,
Count ,
# Allele Count
Values , 1
Count , 1205
# Hom/Het table
Sample_names
Reference
Het
Hom
Missing
# Codon change table
codons , - , AAA , AAC , AAG , AAT , ACA , ACC , ACG , ACT , AGA , AGC , AGG , AGT , ATA , ATC , ATG , ATT , CAA , CAC , CAG , CAT , CCA , CCC , CCG , CCT , CGA , CGC , CGG , CGT , CTA , CTC , CTG , CTT , GAA , GAC , GAG , GAT , GCA , GCC , GCG , GCT , GGA , GGC , GGG , GGT , GTA , GTC , GTG , GTT , TAA , TAC , TAG , TAT , TCA , TCC , TCG , TCT , TGA , TGC , TGG , TGT , TTA , TTC , TTG , TTT
- , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
AAA , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
AAC , 1 , 1 , 0 , 0 , 36 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 9 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
AAG , 4 , 8 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 12 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
AAT , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
ACA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
ACC , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 1 , 0 , 3 , 38 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 9 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
ACG , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 45 , 3 , 0 , 5 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 51 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
ACT , 7 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 2 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
AGA , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
AGC , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 25 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
AGG , 0 , 0 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
AGT , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
ATA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
ATC , 3 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 3 , 21 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 12 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
ATG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 19 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0
ATT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CAA , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CAC , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 28 , 3 , 3 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CAG , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 9 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CAT , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CCA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 9 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CCC , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 5 , 29 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 25 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CCG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 55 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 40 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CCT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 8 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CGA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 15 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 15 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CGC , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 54 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 16 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 41 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CGG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 58 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 6 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 26 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CGT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 15 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0
CTA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
CTC , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 15 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 11 , 0 , 0
CTG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0 , 0 , 9 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 32 , 17 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 10 , 0
CTT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1
GAA , 0 , 9 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GAC , 3 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 34 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GAG , 4 , 0 , 0 , 28 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 26 , 2 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GAT , 0 , 0 , 0 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 8 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GCA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 10 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GCC , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 23 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 5 , 0 , 11 , 51 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 11 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GCG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 43 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 31 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GCT , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 21 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 6 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GGA , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GGC , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 16 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 11 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 4 , 29 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GGG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 28 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 19 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GGT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0
GTA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
GTC , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 20 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 2 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0
GTG , 10 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 27 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 9 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 15 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 16 , 10 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0
GTT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
TAA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
TAC , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 15 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0
TAG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
TAT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0
TCA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
TCC , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 5 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 11 , 0 , 5 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0
TCG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 33 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 29 , 0
TCT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1
TGA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
TGC , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 26 , 0 , 0 , 0 , 0
TGG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
TGT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
TTA , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
TTC , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 19
TTG , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0
TTT , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 3
# Amino acid change table
aa , * , - , ? , A , C , D , E , F , G , H , I , K , L , M , N , P , Q , R , S , T , V , W , Y
* , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
- , 0 , 0 , 12 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
? , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
A , 0 , 1 , 0 , 123 , 0 , 2 , 5 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 6 , 58 , 45 , 0 , 0
C , 2 , 0 , 0 , 0 , 29 , 0 , 0 , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4
D , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 39 , 6 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 8 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 8 , 0 , 8
E , 3 , 4 , 0 , 0 , 0 , 5 , 29 , 0 , 7 , 0 , 0 , 37 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
F , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 22 , 0 , 0 , 0 , 0 , 12 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0
G , 0 , 1 , 0 , 5 , 6 , 5 , 4 , 0 , 66 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 53 , 23 , 0 , 5 , 1 , 0
H , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 29 , 0 , 0 , 0 , 0 , 2 , 6 , 1 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 6
I , 0 , 3 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 26 , 0 , 0 , 3 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 8 , 14 , 0 , 0
K , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 16 , 0 , 0 , 0 , 0 , 11 , 0 , 1 , 0 , 0 , 8 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
L , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 12 , 0 , 3 , 0 , 0 , 88 , 3 , 0 , 11 , 7 , 0 , 2 , 0 , 5 , 0 , 0
M , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 19 , 5 , 0 , 0
N , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 14 , 0 , 0 , 0 , 0 , 7 , 1 , 0 , 0 , 37 , 0 , 0 , 0 , 3 , 2 , 0 , 0 , 4
P , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 61 , 0 , 0 , 119 , 3 , 2 , 34 , 4 , 0 , 0 , 0
Q , 9 , 7 , 0 , 0 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 4 , 0 , 1 , 2 , 0 , 0 , 0 , 4 , 10 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
R , 15 , 2 , 0 , 0 , 47 , 0 , 0 , 0 , 0 , 69 , 0 , 9 , 6 , 0 , 0 , 6 , 73 , 39 , 0 , 6 , 0 , 26 , 0
S , 0 , 2 , 0 , 1 , 7 , 0 , 0 , 8 , 10 , 0 , 1 , 0 , 29 , 0 , 5 , 2 , 0 , 5 , 77 , 5 , 0 , 0 , 5
T , 0 , 7 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 12 , 2 , 0 , 51 , 4 , 11 , 0 , 4 , 8 , 104 , 0 , 0 , 0
V , 0 , 16 , 0 , 19 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 30 , 0 , 16 , 27 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 37 , 0 , 0
W , 3 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 2 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 1 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0
Y , 3 , 2 , 0 , 0 , 4 , 0 , 0 , 2 , 0 , 6 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 0 , 19
# Chromosome change table
22, Position,0,1000000,2000000,3000000,4000000,5000000,6000000,7000000,8000000,9000000,10000000,11000000,12000000,13000000,14000000,15000000,16000000,17000000,18000000,19000000,20000000,21000000,22000000,23000000,24000000,25000000,26000000,27000000,28000000,29000000,30000000,31000000,32000000,33000000,34000000,35000000,36000000,37000000,38000000,39000000,40000000,41000000,42000000,43000000,44000000,45000000,46000000,47000000,48000000,49000000,50000000,51000000
22,Count,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,2,0,0,236,0,0,0,77,336,11,203,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,242,0,0,0,135,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0